RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB22AQ9UL26 194 aa9.89□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGALS9O00182 355 aa9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFNGO00587 321 aa9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRF3Q14653 427 aa9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HES5Q5TA89 166 aa9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 V9GY05 133 aa9.88□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A075B6Q4 140 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2C1O95371 312 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSMCR30P0CW71 290 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNB3P16520 340 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GADD45AP24522 165 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD9Q7L273 389 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YIPF6Q96EC8 236 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.87□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM213A2RRL7 107 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMX3A6NHT5 357 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX22C9J3V5 150 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCGR3BO75015 233 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABARAPO95166 117 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LY6G6CO95867 125 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBLN1P23435 193 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL3P36405 182 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZS49 121 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPHB5Q86YW7 130 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC140Q96MF4 163 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CENPOQ9BU64 300 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HERC2O95714 4834 aa9.86□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MWP6 167 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB27BO00194 218 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-23P01764 117 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMD7P51665 324 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FABP5Q01469 135 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMS2P11Q13670 270 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR51E2Q9H255 320 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLXQ9UH92 298 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXorf65A6NEN9 183 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUPR2A6NF83 97 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A6NJY4 79 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 J3QRK9 145 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KBTBD11O94819 623 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFB8O95169 186 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD36P16671 472 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TALDO1P37837 337 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARFRP1Q13795 201 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S4R3C0 116 aa9.85□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E7EUB6 86 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB6AP20340 208 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTF1Q16619 201 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4A47Q6IF82 309 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTNL8Q6UX41 500 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4S2Q8NH73 311 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2A7Q96R45 310 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms