RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.89□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 MAGT1Q9H0U3 335 aa4.89□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM133Q9H2Q1 129 aa4.89□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.89□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 RBKSQ9H477 322 aa4.89□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.89□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.89□□□□□ -1.63
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C6orf48-208ENST00000395788 A8MXK9 166 aa4.88□□□□□ -1.63
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C6orf48-208ENST00000395788 ARG1P05089 322 aa4.88□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 OR8U8P0C7N1 319 aa4.88□□□□□ -1.63
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C6orf48-208ENST00000395788 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
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C6orf48-208ENST00000395788 CXorf58Q96LI9 332 aa4.88□□□□□ -1.63
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C6orf48-208ENST00000395788 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa4.88□□□□□ -1.63
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C6orf48-208ENST00000395788 TMEM140Q9NV12 185 aa4.88□□□□□ -1.63
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C6orf48-208ENST00000395788 ZNRD1Q9P1U0 126 aa4.88□□□□□ -1.63
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C6orf48-208ENST00000395788 PAX1P15863 534 aa4.87□□□□□ -1.63
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C6orf48-208ENST00000395788 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
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C6orf48-208ENST00000395788 VWC2Q2TAL6 325 aa4.87□□□□□ -1.63
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C6orf48-208ENST00000395788 ZNF525Q8N782 197 aa4.87□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 Q8N7P7 452 aa4.87□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.87□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 OR1S2Q8NGQ3 325 aa4.87□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 OR5C1Q8NGR4 320 aa4.87□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 DTD1Q8TEA8 209 aa4.87□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 OR4C12Q96R67 309 aa4.87□□□□□ -1.63
C6orf48-208ENST00000395788 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.87□□□□□ -1.63
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