RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 SDF2Q99470 211 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ZNF236Q9UL36 1845 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 A0A1B0GWA3 101 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 hADV38S2A0JD32 116 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 A8MWV9 139 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ARL16Q0P5N6 197 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 DEFB125Q8N687 156 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 CT55Q8WUE5 264 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ERG28Q9UKR5 140 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 SIP14410 1827 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 IGHV3-9P01782 118 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 PRSS1P07477 247 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 OR9G9P0C7N8 305 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 FOXL1Q12952 345 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 GPR82Q96P67 336 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 A0A0G2JMZ2 1700 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 H3BRM9 83 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 DHHO43323 396 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 GFRALQ6UXV0 394 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 BCORP1Q8N888 145 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 OR4X2Q8NGF9 303 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 SLC22A24Q8N4F4 322 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 OR1F12Q8NHA8 337 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 PP6455Q8WZ26 134 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 F8W1H4 67 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 MORN2Q502X0 79 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 A0A0A6YYD5 115 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 FNDC10F2Z333 226 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 HMGA2P52926 109 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 AAED1Q7RTV5 226 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 NMNAT3Q96T66 252 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 LINC00271P0C7V0 271 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 MFAP2P55001 183 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 MST1LQ2TV78 715 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 Q6ZWC4 215 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 PELI1Q96FA3 418 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 BCL2L10Q9HD36 194 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 THSD7BQ9C0I4 1608 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 MGAMO43451 1857 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 IAPPP10997 89 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 SLC25A38Q96DW6 304 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 CACNA1AO00555 2505 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 SH2D1BO14796 132 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 STPG3Q8N7X2 389 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 MORN4Q8NDC4 146 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 MRAPQ8TCY5 172 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ATP5G2Q06055 141 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ZNF114Q8NC26 417 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 A0A1B0GUS0 222 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 IL2RAP01589 272 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 LHX2P50458 406 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 CMC2Q9NRP2 79 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ICAM4Q14773 271 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 OR1C1Q15619 314 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ZNF585BQ52M93 769 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 FCRL6Q6DN72 434 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 LRRC75AQ8NAA5 344 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 NPVFQ9HCQ7 196 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 SPANXCQ9NY87 97 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 FFAR1O14842 300 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 NDUFB8O95169 186 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 MALLQ13021 153 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CTIF-202ENST00000382998 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms