RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376238.4

SLC28A3-201, Transcript of solute carrier family 28 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC28A3, Length 4,887 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3-201ENST00000376238 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 KCNE5Q9UJ90 142 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 EMCNQ9ULC0 261 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 HMSDA8MTL9 139 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 C10orf142B7Z368 130 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 E9PLD3 99 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 H0YL77 283 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 EPPINO95925 133 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 PYYP10082 97 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 CA7P43166 264 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 RGNQ15493 299 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 TMEM219Q86XT9 240 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 MZB1Q8WU39 189 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 ACOT13Q9NPJ3 140 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 PARP11Q9NR21 331 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 NKX2-6A6NCS4 301 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 OR2A4O95047 310 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 SRIP30626 198 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 SELENOPP49908 381 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 BTG2P78543 158 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 EGR3Q06889 387 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 NANOGP8Q6NSW7 305 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 LYPD8Q6UX82 237 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 PPP1R27Q86WC6 154 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 GPR78Q96P69 363 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 OR2A7Q96R45 310 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 NICN1Q9BSH3 213 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 TMEM243Q9BU79 118 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 NANOGQ9H9S0 305 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 TAAR3PQ9P1P4 343 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 ATRXP46100 2492 aa4.81□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 SHISA9B4DS77 424 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 UPK2O00526 184 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 MLNRO43193 412 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 SPINT2O43291 252 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 SYNGR1O43759 233 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 PRSS23O95084 383 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 PGA4P0DJD7 388 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 PGA5P0DJD9 388 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 TFPI2P48307 235 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 CLDN15P56746 228 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 RPL30P62888 115 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 HLA-DRB3P79483 266 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 SLC38A11Q08AI6 406 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 C16orf92Q96LL3 132 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 FAM186AA6NE01 2351 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 A0A1W2PNR3 127 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 UPK3AO75631 287 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 OR9G9P0C7N8 305 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 EGR1P18146 543 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 PTGER1P34995 402 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 TGIF1Q15583 401 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 OR9G1Q8NH87 305 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 OBSL1O75147 1896 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 LINC00869P0C866 280 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 FOLR2P14207 255 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 PSG4Q00888 419 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 AQP6Q13520 282 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 SPHARQ15513 63 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 IGFL2Q6UWQ7 119 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 SLC25A42Q86VD7 318 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 PELI3Q8N2H9 469 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 ZNF721Q8TF20 911 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 MDFIQ99750 246 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 EHFQ9NZC4 300 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 H3BMG7 143 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 REG1BP48304 166 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 KCNMB1Q16558 191 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 GUCA2BQ16661 112 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 C1orf140Q5VVS0 124 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 DNM1P46Q6ZS02 220 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 TMEM255BQ8WV15 326 aa4.8□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.79□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 A0A0U1RQV5 110 aa4.79□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 ASPDHA6ND91 283 aa4.79□□□□□ -1.64
SLC28A3-201ENST00000376238 F8WDY8 70 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms