RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 DEFB136Q30KP8 78 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RAB12Q6IQ22 244 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 JAGN1Q8N5M9 183 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM104Q8NE00 496 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 OR1N2Q8NGR9 330 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 OR1L1Q8NH94 360 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 UBALD1Q8TB05 177 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 GHSRQ92847 366 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SMIM19Q96E16 107 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM80Q96HE8 168 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RDH12Q96NR8 316 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SELENOIQ9C0D9 397 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CST11Q9H112 138 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 OR51J1Q9H342 316 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PARP11Q9NR21 331 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ABRACLQ9P1F3 81 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 GHRLQ9UBU3 117 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 AASSQ9UDR5 926 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RNF150Q9ULK6 438 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RYR3Q15413 4870 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ERICH4A6NGS2 130 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 I3L521 148 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 OVOL1O14753 267 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SLC31A2O15432 143 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 NBR2O15453 112 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 YPEL1O60688 119 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PDCD6O75340 191 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SAP30O75446 220 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SC5DO75845 299 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RBBP9O75884 186 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 UBBP0CG47 229 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 MGMTP16455 207 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 VHLP40337 213 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RANBP1P43487 201 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CAMPP49913 170 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RAB9AP51151 201 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ACTBP60709 375 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PLGLAQ15195 96 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 C5orf64Q2M2E5 130 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 MORN2Q502X0 79 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TTC23Q5W5X9 447 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 GAPTQ8N292 157 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF439Q8NDP4 499 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 OR4K15Q8NH41 348 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 GALMQ96C23 342 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 YPEL2Q96QA6 119 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 LYSTQ99698 3801 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SLC29A1Q99808 456 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 HSPB9Q9BQS6 159 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 S100A14Q9HCY8 104 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PALMDQ9NP74 551 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 C8orf4Q9NR00 106 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 JPT1Q9UK76 154 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 A0A1W2PPK0 400 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 OR5H14A6NHG9 310 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 LINC01619G3V211 115 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RAB29O14966 203 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 WBP4O75554 376 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 BAG2O95816 211 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms