RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 A0A087WW49 117 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GW64 132 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC160A6NGH7 325 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 E7EUB6 86 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 HPRT1P00492 218 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 HRASP01112 189 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 OR4A47Q6IF82 309 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 OR1N2Q8NGR9 330 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 VSTM2AQ8TAG5 236 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 BORCS5Q969J3 196 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM68Q96MH6 324 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 HMX3A6NHT5 357 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TEX22C9J3V5 150 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 H3BUA1 57 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 GABARAPH6UMI1 98 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ACTL6BO94805 426 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CD74P04233 296 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 RPA2P15927 270 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CD40LGP29965 261 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TAS2R31P59538 309 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP10-11P60412 298 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF616Q08AN1 781 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 IL18Q14116 193 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 POU2AF1Q16633 256 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 MCFD2Q8NI22 146 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 C15orf40Q8WUR7 153 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM4Q8WVI0 70 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 FCAMRQ8WWV6 532 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 COA4Q9NYJ1 87 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 BET1LQ9NYM9 111 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 MPPED1O15442 326 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 PRH1P02810 166 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 NQO2P16083 231 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 F2RP25116 425 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 SLURP1P55000 103 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 UCP3P55916 312 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF585BQ52M93 769 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 HRASLSQ9HDD0 168 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM140Q9NV12 185 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 COMMD9Q9P000 198 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CGB1A6NKQ9 187 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 LINC01619G3V211 115 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 UPK2O00526 184 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 CTDSPLO15194 276 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 IFNA6P05013 189 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 OR8U8P0C7N1 319 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 OR9G9P0C7N8 305 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TBPP20226 339 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TNFSF8P32971 234 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 LPAR6P43657 344 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PPP5CP53041 499 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TAS2R19P59542 299 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 RPL8P62917 257 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF45Q02386 682 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D26Q86UD7 250 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 SLC38A6Q8IZM9 456 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 CD300LFQ8TDQ1 290 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 SPIN2AQ99865 258 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 SOSTQ9BQB4 213 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 BRI3O95415 125 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 RAB3DO95716 219 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF735P0CB33 412 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PGAM2P15259 253 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-GP17693 338 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PI3P19957 117 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 MAS1LP35410 378 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 STEAP1BQ6NZ63 245 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 LPCAT3Q6P1A2 487 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms