RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 WFDC8Q8IUA0 241 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 MANBALQ9NQG1 85 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM242Q9NWH2 141 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 RPP30P78346 268 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 POU2AF1Q16633 256 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 LYG1Q8N1E2 194 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 GGACTQ9BVM4 153 aa17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM250H0YL14 139 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 RPS10P46783 165 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 CCL8P80075 99 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 FABP9Q0Z7S8 132 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM30BQ3MIR4 351 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4A47Q6IF82 309 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 RHOVQ96L33 236 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM14BQ9NUH8 114 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF835Q9Y2P0 537 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 KBTBD11O94819 623 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMB3P49720 205 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 GCSAMLQ5JQS6 135 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 TREML4Q6UXN2 200 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 ADTRPQ96IZ2 230 aa17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 ATMQ13315 3056 aa17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 C17orf100A8MU93 164 aa17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4A8P0C604 315 aa17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 IRF2P14316 349 aa17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 FOSL1P15407 271 aa17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 GNG10P50151 68 aa17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 BSPH1Q075Z2 132 aa17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 ABHD12Q8N2K0 398 aa17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 SMIM7Q9BQ49 75 aa17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 ACACAQ13085 2346 aa17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 AP4M1O00189 453 aa17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 CYB5BO43169 146 aa17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 MPDU1O75352 247 aa17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 FCN3O75636 299 aa17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 YIF1AO95070 293 aa17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 LURAP1LQ8IV03 231 aa17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 C1orf159Q96HA4 380 aa17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 MGST2Q99735 147 aa17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 SSX3Q99909 188 aa17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 MS4A5Q9H3V2 200 aa17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 NAT8Q9UHE5 227 aa17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM249Q2WGJ8 235 aa17.02■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 GFRALQ6UXV0 394 aa17.02■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB1CQ92928 201 aa17.02■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 GGTLC1Q9BX51 225 aa17.02■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC00312Q9Y6C7 94 aa17.02■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 APC2O95996 2303 aa17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 TNFRSF1AP19438 455 aa17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 ASCL5Q7RTU5 278 aa17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 CLDN34H7C241 214 aa17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 SOX15O60248 233 aa17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 OPRK1P41145 380 aa17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 SPACA3Q8IXA5 215 aa17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 PARLQ9H300 379 aa17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNRD1Q9P1U0 126 aa17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa17■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 SMCO3A2RU48 225 aa17■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 NKX6-3A6NJ46 265 aa17■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 PAGE4O60829 102 aa17■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 S100A8P05109 93 aa17■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC00469Q8N7U9 141 aa17■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 hADV38S2A0JD32 116 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 TMPRSS2O15393 492 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 CT45A6P0DMU7 189 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 CT45A5P0DMU8 189 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 CT45A7P0DMV0 189 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF674Q2M3X9 581 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 CTDSP1Q9GZU7 261 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 PCP4L1A6NKN8 68 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 MYOD1P15172 320 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 TBR1Q16650 682 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4F5Q8NH21 305 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4F4Q96R69 305 aa16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 RPL23P62829 140 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM241Q24JQ0 296 aa16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 C1orf87Q8N0U7 546 aa16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC24A4Q8NFF2 622 aa16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1-202ENST00000335475 SMIM6P0DI80 62 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms