RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV3-7P01780 117 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 HES3Q5TGS1 186 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 OR8B3Q8NGG8 313 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 RAB37Q96AX2 223 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 WDR54Q9H977 334 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM131Q92545 1883 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CGAP01215 116 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 MT-ND6P03923 174 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TNFRSF4P43489 277 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 PSG5Q15238 335 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 RFESDQ8TAC1 157 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC30A6NM36 301 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 OR10J4P0C629 311 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CATR1Q13166 79 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 RRHO14718 337 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FOXH1O75593 365 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SSTR5P35346 364 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SARAFQ96BY9 339 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 OR2H1Q9GZK4 316 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 GP6Q9HCN6 339 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CXCL13O43927 109 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 AMY1AP04745 511 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CRYGSP22914 178 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SRYQ05066 204 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 PNKDQ8N490 385 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 DLL3Q9NYJ7 618 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TAX1BP3O14907 124 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 HLA-DQA1P01909 254 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 GCHFRP30047 84 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 MMP23AO75900 390 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CSN3P07498 182 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00869P0C866 280 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 GABRG2P18507 467 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 C10orf128Q5T292 105 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 ASCL4Q6XD76 172 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM38BQ9NVV0 291 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 A0A0J9YW62 118 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 C17orf98A8MV24 154 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CELA2AP08217 269 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 ESDP10768 282 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 MUC15Q8N387 334 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 NEUROG1Q92886 237 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 ABCA1O95477 2261 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 VAMP5O95183 116 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV4-34P06331 123 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CELA3BP08861 270 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 ABHD12Q8N2K0 398 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 OR4A16Q8NH70 328 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CORTO00230 105 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 RHBDL1O75783 438 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 PCBD1P61457 104 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SLAQ13239 276 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM251Q8N6I4 163 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FAM216AQ8WUB2 273 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM54Q969K7 222 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SGK494Q96LW2 274 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms