RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GW64 132 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 MSGN1A6NI15 193 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 E7EUB6 86 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 AKAIN1P0CW23 69 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 PI3P19957 117 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 MEF2DQ14814 521 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 TNXAQ16473 311 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 C10orf55Q5SWW7 151 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 OR4A47Q6IF82 309 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D26Q86UD7 250 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 ZNF695Q8IW36 515 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 MMD2Q8IY49 270 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 WFDC9Q8NEX5 89 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A9Q9NRM0 540 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 BET1LQ9NYM9 111 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 NOTCH1P46531 2555 aa17.34■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 TRAV3A0A0B4J244 114 aa17.33■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 A6NHS1 94 aa17.33■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 PF4V1P10720 104 aa17.33■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 LPAR6P43657 344 aa17.33■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 RND3P61587 244 aa17.33■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 OR5M8Q8NGP6 311 aa17.33■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 VSTM2AQ8TAG5 236 aa17.33■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 NQO2P16083 231 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 PPP5CP53041 499 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 PYDC2Q56P42 97 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 POC5Q8NA72 575 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 OR5T1Q8NG75 326 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 OR13C8Q8NGS7 320 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 MARCH1Q8TCQ1 289 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 UBE2E2Q96LR5 201 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 P2RX4Q99571 388 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 GNB4Q9HAV0 340 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 COMMD9Q9P000 198 aa17.32■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 MPPED1O15442 326 aa17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1-39P01597 117 aa17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1D-39P04432 117 aa17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 MYOD1P15172 320 aa17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A1P30531 599 aa17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 Q8N402 240 aa17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 RAX2Q96IS3 184 aa17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 TMEM68Q96MH6 324 aa17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 SRRQ9GZT4 340 aa17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 CGB1A6NKQ9 187 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 DISC1C4P0D8 188 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 TEX22C9J3V5 150 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 I3L521 148 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 UPK2O00526 184 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 APELAP0DMC3 54 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 PGAM2P15259 253 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 PIGPP57054 158 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 TMEM65Q6PI78 240 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 OR51S1Q8NGJ8 323 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 OR4A5Q8NH83 315 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 C4orf3Q8WVX3 66 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 MS4A10Q96PG2 267 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 DUX3Q96PT4 197 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 AIFM2Q9BRQ8 373 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 TMEM140Q9NV12 185 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A8Q9NY64 477 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa17.3■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 NUDT19A8MXV4 375 aa17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 BRI3O95415 125 aa17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 RPA2P15927 270 aa17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 MAS1LP35410 378 aa17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 MYCNOSP40205 109 aa17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 DEFB136Q30KP8 78 aa17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 CADM3Q8N126 398 aa17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 LINC00482Q8N8I6 264 aa17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 GPR132Q9UNW8 380 aa17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 VSIG4Q9Y279 399 aa17.29■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 MARCH11A6NNE9 402 aa17.28■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 RPL8P62917 257 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 RUNX1Q01196 453 aa17.28■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 ZFAND1Q8TCF1 268 aa17.28■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 TP53RKQ96S44 253 aa17.28■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 C5orf66Q9H5L9 145 aa17.28■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 HMX3A6NHT5 357 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 H3BUA1 57 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 CCL24O00175 119 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 ACTL6BO94805 426 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 KRASP01116 189 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 HLA-GP17693 338 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 S100GP29377 79 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 G6PCP35575 357 aa17.27■□□□□ 0.36
SYF2-201ENST00000236273 SPANXN2Q5MJ10 180 aa17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms