RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 LEMD1Q68G75 181 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 HIST1H4GQ99525 98 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 TJP1Q07157 1748 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 LMX1BO60663 402 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 SAP30O75446 220 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 CRYBA2P53672 197 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 TBR1Q16650 682 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 FAM201AQ5SY85 155 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 FAM186AA6NE01 2351 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 PSCAO43653 123 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF708P17019 499 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 C7orf66A4D0T2 115 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-201ENST00000220888 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 PAX1P15863 534 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 ICAM4Q14773 271 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF415Q09FC8 603 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 NABP2Q9BQ15 211 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 NINQ8N4C6 2090 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 DIRC3C9JPN6 131 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM250H0YL14 139 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 HLA-DQA1P01909 254 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 DNLZQ5SXM8 178 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 ISOC2Q96AB3 205 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 GHRHP01286 108 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 WNT2P09544 360 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 AQP3Q92482 292 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 SRD5A1P18405 259 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV1-2P23083 117 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 CNTFRP26992 372 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 LEPP41159 167 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 C10orf111Q8N326 155 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 LAMB1P07942 1786 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 CTSBP07858 339 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 NPBWR2P48146 333 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 DRAM1Q8N682 238 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 SPSB4Q96A44 273 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 FAM206AQ9NX38 181 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 NBR2O15453 112 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 TEX45Q8NA69 505 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 AMELYQ99218 206 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 CRYBB3P26998 211 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM42Q69YG0 159 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 LRP5O75197 1615 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 C7orf71A4D174 169 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 SLC25A20O43772 301 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 LEPROTL1O95214 131 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF688P0C7X2 276 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.94□□□□□ -0.98
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