RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635986.1

POLG-215, Transcript of DNA polymerase gamma, catalytic subunit, human

TSL 5

Gene POLG, Length 2,351 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLG-215	ENST00000635986		A0A1W2PPE2	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	COLCA2	A8K830	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986		E7EQL1	145 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	CRYBA1	P05813	215 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	DDB2	Q92466	427 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	SLC25A22	Q9H936	323 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	ABCA4	P78363	2273 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	SHISA9	B4DS77	424 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	PLAU	P00749	431 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	IFNA10	P01566	189 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	NQO2	P16083	231 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RAB7A	P51149	207 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	TMPRSS3	P57727	454 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RELB	Q01201	579 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	LINC01560	Q8TB33	94 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986		A0A1W2PPH5	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	SMCO3	A2RU48	225 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	OR8U8	P0C7N1	319 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	SERF2	P84101	59 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	TNC	P24821	2201 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RRH	O14718	337 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	OR4S2	Q8NH73	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RHOV	Q96L33	236 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	hADV38S2	A0JD32	116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	PPIAL4D	F5H284	164 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986		H3BQ15	152 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	TMEM178B	H3BS89	294 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	OPN1MW	P04001	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RAB11A	P62491	216 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	IGKV1-16	P04430	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	SPCS3	P61009	180 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	OR4A47	Q6IF82	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	ZNF429	Q86V71	674 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	LHX4	Q969G2	390 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	DIRC2	Q96SL1	478 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	ZNF727	A8MUV8	499 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	BCL2	P10415	239 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	REG1B	P48304	166 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	ATP6V1F	Q16864	119 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	AVPI1	Q5T686	147 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	RAB39B	Q96DA2	213 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLG-215	ENST00000635986	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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