RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 REG4Q9BYZ8 158 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF223E7ERA6 249 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB13P51153 203 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 MINOS1Q5TGZ0 78 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 MFFQ9GZY8 342 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM140Q9NV12 185 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPI3 338 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PRD5 423 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PRF3 423 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PRM7 423 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF222A6NCQ9 220 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 L7N2F9 121 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 OR9G9P0C7N8 305 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4C13Q8NGP0 309 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf1Q9H5F2 150 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 WNK2Q9Y3S1 2297 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV20A0A0B4J274 112 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A26D6RGX4 464 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 NXPH3O95157 252 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 MOB3BQ86TA1 216 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC01356Q8N9X3 169 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 Q96MF0 132 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 AIFM2Q9BRQ8 373 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGT1Q9H0U3 335 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 E5RGE8 158 aa20.08■□□□□ 0.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 KCNAB3O43448 404 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 LGALS4P56470 323 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF345Q14585 488 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4A47Q6IF82 309 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8H3Q8N146 312 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2F2O95006 317 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2F1Q13607 317 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 AARDQ4LEZ3 155 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 HARBI1Q96MB7 349 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 HIF1ANQ9NWT6 349 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPB7Q9UBY9 170 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 HILPDAQ9Y5L2 63 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 OOSP1A8MZH6 123 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 GATA3P23771 443 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 RELBQ01201 579 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 AQP10Q96PS8 301 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 AUP1Q9Y679 476 aa20.07■□□□□ 0.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 CHST1O43916 411 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 SSSCA1O60232 199 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS16P62249 146 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF9Q07011 255 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNRGQ8N5I3 272 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 CFHR4Q92496 578 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 MSGN1A6NI15 193 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 WRBO00258 174 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMM23O14925 209 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 SYNGR2O43760 224 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 S100A11P31949 105 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RY1P47900 373 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 DYNAPQ8N1N2 210 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4A16Q8NH70 328 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 AJUBAQ96IF1 538 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 C7orf69Q9H7B7 122 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 BET1LQ9NYM9 111 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV2-23P01705 113 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 HKR1P10072 659 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2B8PP59922 312 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 SSX2Q16385 188 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf50Q8WW18 174 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 MALSU1Q96EH3 234 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 RITA1Q96K30 269 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL6Q9H0F7 186 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC79Q9P2D8 2635 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 PDZD2O15018 2839 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 NPFFO15130 113 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM50AO95807 157 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 C4BPBP20851 252 aa20.03■□□□□ 0.8
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