RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	BORCS8	Q96FH0	119 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061		Q96MT0	163 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR84	Q9NQS5	396 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A087WYN8	130 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061		A6NIN4	97 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	CDC42EP2	O14613	210 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	DHFR	P00374	187 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ARPC2	O15144	300 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF682	O95780	498 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	PRM2	P04554	102 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	LYN	P07948	512 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	HLA-DRB4	P13762	266 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	GYPE	P15421	78 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	TSPO	P30536	169 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	FUT6	P51993	359 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	SS18	Q15532	418 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	MORN2	Q502X0	79 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	AGK	Q53H12	422 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	CPO	Q8IVL8	374 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	AGR3	Q8TD06	166 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC107	Q8WV48	283 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ST8SIA2	Q92186	375 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF185	Q96GF1	192 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	LINC00479	Q96M42	142 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	GPHA2	Q96T91	129 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ABHD6	Q9BV23	337 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	NRN1	Q9NPD7	142 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	CD300A	Q9UGN4	299 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	HELT	A6NFD8	242 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	CLIC1	O00299	241 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ACTL6B	O94805	426 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	YIF1A	O95070	293 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	PHB	P35232	272 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	HMGA2	P52926	109 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	PDPN	Q86YL7	162 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	TEAD3	Q99594	435 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	UBE2QL1	A1L167	161 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	HMX3	A6NHT5	357 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	NAPSA	O96009	420 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	APOA2	P02652	100 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	DEFA4	P12838	97 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	CRHBP	P24387	322 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	NME5	P56597	212 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	DNAJB13	P59910	316 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	GNMT	Q14749	295 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF709	Q8N972	641 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2T4	Q8NH00	348 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061		Q8TAT8	98 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	NRG4	Q8WWG1	115 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	MS4A14	Q96JA4	679 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	HARBI1	Q96MB7	349 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-222	ENST00000626061	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		3.72	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.4 ms