RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572656.2

TRAPPC1-205, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC1, Length 409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-205ENST00000572656 MMD2Q8IY49 270 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 UFD1Q92890 307 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 RAB3CQ96E17 227 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 GINS4Q9BRT9 223 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 CENPOQ9BU64 300 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 RAB22AQ9UL26 194 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 ERICH4A6NGS2 130 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR2C1O95371 312 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 LY6G6CO95867 125 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 CBLN1P23435 193 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 CDK10Q15131 360 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRAM1Q15629 374 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 GPHB5Q86YW7 130 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC1-205ENST00000572656 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 GNB3P16520 340 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 GADD45AP24522 165 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 MAP2K4P45985 399 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 PSMD7P51665 324 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 PLA2G7Q13093 441 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 IRF3Q14653 427 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 Q6ZS49 121 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 V9GY05 133 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF320A2RRD8 509 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM213A2RRL7 107 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 DPPA5A6NC42 116 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 CXorf65A6NEN9 183 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 NUPR2A6NF83 97 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 HMX3A6NHT5 357 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 TEX22C9J3V5 150 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 MFNGO00587 321 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 FCGR3BO75015 233 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 HSMCR30P0CW71 290 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 ARL3P36405 182 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 HES5Q5TA89 166 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR51E2Q9H255 320 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 SCN3BQ9NY72 215 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 MLXQ9UH92 298 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 A0A075B6Q4 140 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 A8MWP6 167 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 RAB27BO00194 218 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 EBAG9O00559 213 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 SLC22A5O76082 557 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 NDUFB8O95169 186 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGHV3-23P01764 117 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 CRYGCP07315 174 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 MAS1LP35410 378 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 TALDO1P37837 337 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 FABP5Q01469 135 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 TNFRSF9Q07011 255 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 PMS2P11Q13670 270 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 ARFRP1Q13795 201 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 RCN1Q15293 331 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 SSX1Q16384 188 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 KLK9Q2XQG4 91 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR4A47Q6IF82 309 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 KCTD9Q7L273 389 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC1-205ENST00000572656 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.37□□□□□ -1.23
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