RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570641.1

SPNS2-202, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 783 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-202ENST00000570641 VENTXO95231 258 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 IGKV1-16P04430 117 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 FBP1P09467 338 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 SLC25A6P12236 298 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 LGALS7P47929 136 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 GPR146Q96CH1 333 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 CHIAQ9BZP6 476 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 OR2A4O95047 310 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 H2BFSP57053 126 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 RAP2BP61225 183 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 OR10C1Q96KK4 312 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 RHOVQ96L33 236 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 OR2A7Q96R45 310 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 A0A0G2JRQ6 117 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 A0A1B0GU03 582 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 MPTX1A8MV57 137 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 MOSP00540 346 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 IGKV1D-33P01593 117 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 IGKV1-33P01594 117 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 P0C879 139 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 PAX6P26367 422 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 SMCO1Q147U7 214 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 SSX9Q7RTT3 188 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 NEURL2Q9BR09 285 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 NMES1Q9C002 83 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 FAM106CPP0CH98 169 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 FOSL1P15407 271 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 DYNLT3P51808 116 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 EBI3Q14213 229 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 HES1Q14469 280 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 TMEM140Q9NV12 185 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS2-202ENST00000570641 SPDEFO95238 335 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 CD99P14209 185 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 HNF1AP20823 631 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 UBE2KP61086 200 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 AANATQ16613 207 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 OR4A47Q6IF82 309 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 OR4A5Q8NH83 315 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 OR1S1Q8NH92 325 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 COA4Q9NYJ1 87 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 BET1LQ9NYM9 111 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 CACNG5Q9UF02 275 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 SNAPC5O75971 98 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 IGLV2-23P01705 113 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 TMEM11P17152 192 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 TEX45Q8NA69 505 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 OR4A16Q8NH70 328 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 TMEM160Q9NX00 188 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 F8P00451 2351 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 OR9G9P0C7N8 305 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 CD24P25063 80 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 FGL1Q08830 312 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 PSG5Q15238 335 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 Q6ZRM9 215 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 RITA1Q96K30 269 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 SSX3Q99909 188 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 ZFP57Q9NU63 452 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 KIAA1456Q9P272 454 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 CACFD1Q9UGQ2 172 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 AKAP9Q99996 3911 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS2-202ENST00000570641 UPK2O00526 184 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms