RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	FCER2	P06734	321 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	APELA	P0DMC3	54 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	PTHLH	P12272	177 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	ARPC4	P59998	168 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	KCTD9	Q7L273	389 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	PHB2	Q99623	299 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-222	ENST00000567147	LYST	Q99698	3801 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A0G2JLM5	398 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	SAP30	O75446	220 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	TNFAIP8	O95379	198 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	FCGR2C	P31995	323 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	TNXA	Q16473	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	XRCC3	O43542	346 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	BRI3	O95415	125 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	LY86	O95711	162 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	AADAC	P22760	399 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	CDK10	Q15131	360 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ACSM6	Q6P461	480 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ACTL6B	O94805	426 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	LCE6A	A0A183	80 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	MPPED1	O15442	326 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	CBX5	P45973	191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	OR4C12	Q96R67	309 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	TNFSF12	O43508	249 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	PPY	P01298	95 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ZP3	P21754	424 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	DEFA5	Q01523	94 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	OR2A4	O95047	310 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	PRH1	P02810	166 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	LYL1	P12980	280 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	SPN	P16150	400 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	MSMO1	Q15800	293 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	OR2A7	Q96R45	310 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-222	ENST00000567147	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNPS1-222	ENST00000567147	TAS2R20	P59543	309 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNPS1-222	ENST00000567147	FXYD4	P59646	89 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNPS1-222	ENST00000567147	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RNPS1-222	ENST00000567147	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNPS1-222	ENST00000567147	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNPS1-222	ENST00000567147	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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