RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-208	ENST00000563857	GPX8	Q8TED1	209 aa		12.54	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	PHB2	Q99623	299 aa		12.54	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	SPIN2A	Q99865	258 aa		12.54	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		12.54	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	MPPED1	O15442	326 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	HPGDS	O60760	199 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	OR2A4	O95047	310 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	IGLL1	P15814	213 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	ELK1	P19419	428 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF616	Q08AN1	781 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	FAM209B	Q5JX69	171 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	SNAPC3	Q92966	411 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	C5orf30	Q96GV9	206 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	RAX2	Q96IS3	184 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	OR2A7	Q96R45	310 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNPS1-208	ENST00000563857	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	HPRT1	P00492	218 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TBP	P20226	339 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	INSL3	P51460	131 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RAB25	P57735	213 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	FXYD4	P59646	89 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	NDP	Q00604	133 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TNXA	Q16473	311 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	OR11H1	Q8NG94	326 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	MOB3A	Q96BX8	217 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	SCOC	Q9UIL1	159 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857		I3L521	148 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RGS5	O15539	181 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	IGLV2-14	P01704	120 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	PMP2	P02689	132 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TRGV3	P03979	118 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	IFNA6	P05013	189 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	PTHLH	P12272	177 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TPPP2	P59282	170 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TAS2R31	P59538	309 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	USMG5	Q96IX5	58 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RHOV	Q96L33	236 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	KLK15	Q9H2R5	256 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	WIPF1	O43516	503 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RAMP3	O60896	148 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	DHFR	P00374	187 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	FGF2	P09038	288 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	NQO2	P16083	231 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RFX2	P48378	723 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	FHL3	Q13643	280 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	DPPA5	A6NC42	116 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	MSGN1	A6NI15	193 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	LINC01619	G3V211	115 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	GPR31	O00270	319 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	KBTBD11	O94819	623 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	OR9G9	P0C7N8	305 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	HLA-DMA	P28067	261 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	HRH1	P35367	487 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ERVK-16	P61578	105 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	OR5T1	Q8NG75	326 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	BET1L	Q9NYM9	111 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	COMMD9	Q9P000	198 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	CYB5B	O43169	146 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	SOX15	O60248	233 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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