RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 VBP1P61758 197 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 NCS1P62166 190 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 QRFPP83859 136 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 UNC119Q13432 240 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 PSG5Q15238 335 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 SNAPC3Q92966 411 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 PTX4Q96A99 478 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 TM2D1Q9BX74 207 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 KCNK15Q9H427 330 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 FBXL17Q9UF56 701 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 JPT1Q9UK76 154 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 PKHD1P08F94 4074 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 OR5H14A6NHG9 310 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 H0YJW9 148 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 H3BUA1 57 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 SOCS1O15524 211 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 XRCC3O43542 346 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 SPRY2O43597 315 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 CA11O75493 328 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 RAB6AP20340 208 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 RORCP51449 518 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 TMBIM6P55061 237 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 TNFRSF9Q07011 255 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 CTF1Q16619 201 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 STEAP3Q658P3 488 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 SETD6Q8TBK2 473 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 CYYR1Q96J86 154 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 NICN1Q9BSH3 213 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 CCDC160A6NGH7 325 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 BMPR1BO00238 502 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 RAB29O14966 203 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 MPPED1O15442 326 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 YPEL1O60688 119 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 RBBP9O75884 186 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 GABARAPO95166 117 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 CT45A6P0DMU7 189 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 CT45A5P0DMU8 189 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 CT45A7P0DMV0 189 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 MED14OSP0DP75 135 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 FOLR2P14207 255 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 BMI1P35226 326 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 SCAND1P57086 179 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 PLA2G7Q13093 441 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 GALMQ96C23 342 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 RAB3CQ96E17 227 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 YPEL2Q96QA6 119 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 HSF4Q9ULV5 492 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 ETV7Q9Y603 341 aa6.03□□□□□ -1.44
PCNX1-215ENST00000557428 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.02□□□□□ -1.45
PCNX1-215ENST00000557428 A0A075B6Q4 140 aa6.02□□□□□ -1.45
PCNX1-215ENST00000557428 A0A0A6YYD4 124 aa6.02□□□□□ -1.45
PCNX1-215ENST00000557428 C2orf70A6NJV1 201 aa6.02□□□□□ -1.45
PCNX1-215ENST00000557428 PPP5D1E7EU14 171 aa6.02□□□□□ -1.45
PCNX1-215ENST00000557428 TUSC2O75896 110 aa6.02□□□□□ -1.45
PCNX1-215ENST00000557428 SCGNO76038 276 aa6.02□□□□□ -1.45
PCNX1-215ENST00000557428 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PCNX1-215ENST00000557428 APOA2P02652 100 aa6.02□□□□□ -1.45
PCNX1-215ENST00000557428 PRH1P02810 166 aa6.02□□□□□ -1.45
PCNX1-215ENST00000557428 MC5RP33032 325 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.1 ms