RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 TBPP20226 339 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PMELP40967 661 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 HAGHQ16775 308 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 NECAP1Q8NC96 275 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 RPEQ96AT9 228 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 C10orf35Q96D05 121 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ARV1Q9H2C2 271 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 EHFQ9NZC4 300 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 APCP25054 2843 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 XKRY2A2RUG3 117 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 FPR2P25090 351 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 RAB7AP51149 207 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 UCP3P55916 312 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 WDR86Q86TI4 376 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 DTX2Q86UW9 622 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 FRZBQ92765 325 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TXN2Q99757 166 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TUBA4BQ9H853 241 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TNFSF12O43508 249 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PDCD6O75340 191 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 IGKV1D-12P01611 117 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 LIPFP07098 398 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SSTR5P35346 364 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 KLRD1Q13241 179 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 OR5T1Q8NG75 326 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TMEM18Q96B42 140 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TMEM186Q96B77 213 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 GALMQ96C23 342 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ZNF714Q96N38 554 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 A0A0G2JK05 382 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 J3QRE1 110 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 MSMBP08118 114 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SRD5A1P18405 259 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 CORO2AQ92828 525 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SPSB4Q96A44 273 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PSG11Q9UQ72 335 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 GZMBP10144 247 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TAS2R19P59542 299 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ERVFC1-1P60608 527 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 IL24Q13007 206 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ATP6V1FQ16864 119 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SRRM5B3KS81 715 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 MGST3O14880 152 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PPP1R1AQ13522 171 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 OR5R1Q8NH85 324 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 IL22RA2Q969J5 263 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PRR13Q9NZ81 148 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ODAMA1E959 279 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 INAFM1C9JVW0 142 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ITGB1BP1O14713 200 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 CTDSPLO15194 276 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 MPPED1O15442 326 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 FGF16O43320 207 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PSPNO60542 156 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 CEACAM6P40199 344 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-202ENST00000538886 ACSM1Q08AH1 577 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms