RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532872.5

RPS3-218, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-218ENST00000532872 KCTD9Q7L273 389 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 ZMAT4Q9H898 229 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 DAPK2Q9UIK4 370 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 H0Y980 276 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 FCGR3BO75015 233 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 SYNJ2BPP57105 145 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 RPEL1Q2QD12 228 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 MMD2Q8IY49 270 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 Q8N1Y9 231 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 SNAPC3Q92966 411 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 SPIN2AQ99865 258 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 RYR3Q15413 4870 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 A0A087WXM4 84 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 FAM223BA6NKX1 122 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 A8MZ25 164 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 TUSC2O75896 110 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 OR2A4O95047 310 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 IGLV2-14P01704 120 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 TRBV12-3P01733 135 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 SCAND1P57086 179 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 RHOGP84095 191 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 MUC7Q8TAX7 377 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3-218ENST00000532872 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 SSX5O60225 188 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 SDC2P34741 201 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 ATP5G2Q06055 141 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 OR4S2Q8NH73 311 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 OR51E2Q9H255 320 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 PEMTQ9UBM1 199 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 SPATA2Q9UM82 520 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 KBTBD11O94819 623 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 PRH1P02810 166 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 CSN3P07498 182 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 ZNF45Q02386 682 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 MXD1Q05195 221 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 FAM209BQ5JX69 171 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 LCN12Q6JVE5 192 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 NECAP1Q8NC96 275 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 OR2A7Q96R45 310 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 ETV7Q9Y603 341 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 A0A0A6YYH2 397 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 A6NJ64 397 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 BMPR1BO00238 502 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 AIREO43918 545 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 MAS1LP35410 378 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 ARPC4P59998 168 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 CASC10Q5T4H9 136 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 Q8N402 240 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 MFSD4AQ8N468 514 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 BEST4Q8NFU0 473 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 OR5H6Q8NGV6 325 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.74□□□□□ -0.85
RPS3-218ENST00000532872 HMX3A6NHT5 357 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms