RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 FABP7O15540 132 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 AIREO43918 545 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 ACTL6BO94805 426 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 IGKV1-16P04430 117 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 HSMCR30P0CW71 290 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 FOLR2P14207 255 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 CRHBPP24387 322 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 BMI1P35226 326 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 ZNF45Q02386 682 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 ARL6IP1Q15041 203 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 FAM209BQ5JX69 171 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 Q6ZWC4 215 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 SNAPC3Q92966 411 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TMEM203Q969S6 136 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 GINS4Q9BRT9 223 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 OR2D2Q9H210 308 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 KCNK15Q9H427 330 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 COA4Q9NYJ1 87 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 RAB22AQ9UL26 194 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 V9GY05 133 aa8.3□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 C2orf70A6NJV1 201 aa8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 BET1O15155 118 aa8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 RGS10O43665 173 aa8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TALDO1P37837 337 aa8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 RAB3CQ96E17 227 aa8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 GFI1Q99684 422 aa8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 APLNQ9ULZ1 77 aa8.29□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 RTL8CO15255 209 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 CRYGBP07316 175 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TMEM50BP56557 158 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 DEFB135Q30KP9 77 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TMEM177Q53S58 311 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TEX45Q8NA69 505 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 RNF183Q96D59 192 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.28□□□□□ -1.08
RNF4-218ENST00000513284 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 FAM223BA6NKX1 122 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 TUSC2O75896 110 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 FCGR3AP08637 254 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 OR9G9P0C7N8 305 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 CBLN1P23435 193 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 MYL9P24844 172 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 MAP2K4P45985 399 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 CLDN12P56749 244 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 UBE2KP61086 200 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 ARFRP1Q13795 201 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 SSX1Q16384 188 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 TNXAQ16473 311 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 TM4SF20Q53R12 229 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 MGLLQ99685 303 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 SPIN2AQ99865 258 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 VCX3BQ9H321 246 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 MLXQ9UH92 298 aa8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 XRCC3O43542 346 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 SLC22A5O76082 557 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 IGLV2-23P01705 113 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 CTXN2P0C2S0 81 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 APELAP0DMC3 54 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 CD36P16671 472 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 CTRB1P17538 263 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 RAB6AP20340 208 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 FABP5Q01469 135 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.26□□□□□ -1.09
RNF4-218ENST00000513284 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.26□□□□□ -1.09
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