RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511481.5

SEC24D-211, Transcript of SEC24 homolog D, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24D, Length 2,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24D-211ENST00000511481 TBX21Q9UL17 535 aa4.55□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 R4GN57 208 aa4.55□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa4.55□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.55□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 SPRY3O43610 288 aa4.55□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 HYPMO75409 117 aa4.55□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 IFNA5P01569 189 aa4.55□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 IGLC3P0DOY3 106 aa4.54□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.54□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 MSMO1Q15800 293 aa4.54□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 VAMP3Q15836 100 aa4.54□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.54□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.54□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 C20orf196Q8IYI0 205 aa4.54□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 C11orf40Q8WZ69 217 aa4.54□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 H3BTX0 84 aa4.54□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 HCRTR1O43613 425 aa4.54□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 MDH2P40926 338 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.54□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF841Q6ZN19 808 aa4.54□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 PRR22Q8IZ63 422 aa4.54□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 Q8N976 141 aa4.54□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 PSMF1Q92530 271 aa4.54□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 LHX4Q969G2 390 aa4.54□□□□□ -1.68
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SEC24D-211ENST00000511481 C5orf63A6NC05 138 aa4.53□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 CCL16O15467 120 aa4.53□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 LINC00271P0C7V0 271 aa4.53□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 PGCP20142 388 aa4.53□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 LCN2P80188 198 aa4.53□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
SEC24D-211ENST00000511481 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
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