RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q499Y3 187 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ELP2Q6IA86 826 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 MKXQ8IYA7 352 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CEND1Q8N111 149 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR8H2Q8N162 312 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF561Q8N587 486 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR51T1Q8NGJ9 327 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 PIFOQ8TCI5 191 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 GHSRQ92847 366 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 LHX4Q969G2 390 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM106AQ96A25 262 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHIAQ9BZP6 476 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHST6Q9GZX3 395 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 KPTNQ9Y664 436 aa3.28□□□□□ -1.88
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 IRGMA1A4Y4 181 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLDN34H7C241 214 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 M0R1W7 72 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 NPFFO15130 113 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHST1O43916 411 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 B3GALNT1O75752 331 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ALDOBP05062 364 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 OCM2P0CE71 109 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MYL12AP19105 171 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CELP19835 753 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB3AP20336 220 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRKACBP22694 351 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRTN3P24158 256 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SAA4P35542 130 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 RBP2P50120 134 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 BDH1Q02338 343 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TPBGQ13641 420 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 KCNJ8Q15842 424 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 DDI2Q5TDH0 399 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SERPINA12Q8IW75 414 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q8N9L7 120 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM104Q8NE00 496 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PXT1Q8NFP0 134 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM158Q8WZ71 300 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CNBD2Q96M20 576 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPA2Q9H2U2 334 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PALMDQ9NP74 551 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 IL36GQ9NZH8 169 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ONECUT1Q9UBC0 465 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC7A11Q9UPY5 501 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ETV7Q9Y603 341 aa3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A0A6YYD4 124 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MYL12BO14950 172 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MAS1P04201 325 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CSN2P05814 226 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 UCHL1P09936 223 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 OMGP23515 440 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 COX7A1P24310 79 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TGFBR2P37173 567 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 VHLP40337 213 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PTGFRP43088 359 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 UBE2E1P51965 193 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 EDDM3BP56851 147 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 S100A12P80511 92 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 QRFPP83859 136 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 FABP5Q01469 135 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PAX5Q02548 391 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 AESQ08117 197 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 BAMBIQ13145 260 aa3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 UNC119Q13432 240 aa3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms