RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 KIAA1456Q9P272 454 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 CACFD1Q9UGQ2 172 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 VPREB3Q9UKI3 123 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 F8P00451 2351 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 A6NDX4 124 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 MARCH11A6NNE9 402 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 FGF16O43320 207 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 NDUFA3O95167 84 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 UBE2KP61086 200 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 RPL15P61313 204 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SLC9A3R2Q15599 337 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SP6Q3SY56 376 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 OR2B11Q5JQS5 317 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 TEX45Q8NA69 505 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 OR4A5Q8NH83 315 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 R3HDM4Q96D70 268 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 RHOVQ96L33 236 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 TMED3Q9Y3Q3 217 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 NBR2O15453 112 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 S1PR2O95136 353 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 VDAC1P21796 283 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 MMDQ15546 238 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 TMEM268Q5VZI3 342 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 CASTOR1Q8WTX7 329 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SEC22AQ96IW7 307 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 BEX1Q9HBH7 125 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 BET1LQ9NYM9 111 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 MOB4Q9Y3A3 225 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 DBX1A6NMT0 343 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 RRHO14718 337 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 OR2A4O95047 310 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 IFNA21P01568 189 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 IGLV2-23P01705 113 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 IGHV4-59P01825 116 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SLC25A6P12236 298 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 PAX6P26367 422 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 AKR1C2P52895 323 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 HILS1P60008 231 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD55Q3KP44 614 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 DMBX1Q8NFW5 382 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 OR2A7Q96R45 310 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SPIN2AQ99865 258 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SEC22CQ9BRL7 303 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 MMP24Q9Y5R2 645 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SVEP1Q4LDE5 3571 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 KRASP01116 189 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 IGKV1-39P01597 117 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 IGKV1D-39P04432 117 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 MAS1LP35410 378 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 PSG5Q15238 335 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 Q6ZNX1 250 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SLC35G3Q8N808 338 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 OR52B4Q8NGK2 314 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 LHFPL5Q8TAF8 219 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 OR51J1Q9H342 316 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 COA4Q9NYJ1 87 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 FKBP11Q9NYL4 201 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 ALG5Q9Y673 324 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 TCF21O43680 179 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SSNA1O43805 119 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SNAPC5O75971 98 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 KBTBD11O94819 623 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 CRYGBP07316 175 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 P0C879 139 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 HLA-GP17693 338 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 CD24P25063 80 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 G6PCP35575 357 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 HNF4GQ14541 408 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 PLGLAQ15195 96 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 OR4A47Q6IF82 309 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 LIN54Q6MZP7 749 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 FOXRED2Q8IWF2 684 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 MMD2Q8IY49 270 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms