RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 ARPC4P59998 168 aa18.04■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 MFSD4AQ8N468 514 aa18.04■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 OR5T1Q8NG75 326 aa18.04■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 OR5AP2Q8NGF4 316 aa18.04■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 GIMAP1Q8WWP7 306 aa18.04■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 MSGN1A6NI15 193 aa18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 PPYP01298 95 aa18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 IGHV3-11P01762 117 aa18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 FCGR2CP31995 323 aa18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 SLURP1P55000 103 aa18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 ACSM6Q6P461 480 aa18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 MMD2Q8IY49 270 aa18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 OR13F1Q8NGS4 319 aa18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 OR4S2Q8NH73 311 aa18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 CMTM3Q96MX0 182 aa18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 PTHLHP12272 177 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 NAT1P18440 290 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 IDO2Q6ZQW0 420 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 USMG5Q96IX5 58 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 FUNDC2Q9BWH2 189 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
C9orf3-215ENST00000478473 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.471e-7■■■■□ 20.5
C9orf3-215ENST00000478473 OR9G9P0C7N8 305 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 ECI1P42126 302 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 LSM3P62310 102 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 TNXAQ16473 311 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF343Q6P1L6 599 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 SAMD12Q8N8I0 201 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 VSTM2AQ8TAG5 236 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 SPIN2AQ99865 258 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 CCL28Q9NRJ3 127 aa18.01■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 SORL1Q92673 2214 aa18■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 KIR2DS2P43631 304 aa18■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 DHRS11Q6UWP2 260 aa18■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa18■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa18■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 TAS2R8Q9NYW2 309 aa18■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 ZP3P21754 424 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 TAS2R20P59543 309 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 DYRK1AQ13627 763 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM69Q5SWH9 247 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 TTC9CQ8N5M4 171 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 PRR25Q96S07 402 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa17.99■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 KBTBD11O94819 623 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 OR2A4O95047 310 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 APOA1P02647 267 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 MAS1LP35410 378 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 NCS1P62166 190 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 POU2AF1Q16633 256 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 KLK9Q2XQG4 91 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 SECTM1Q8WVN6 248 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 ACOT12Q8WYK0 555 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 OR2A7Q96R45 310 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 KLK9Q9UKQ9 250 aa17.98■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 ACTL6BO94805 426 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 HRASP01112 189 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 SMIM18P0DKX4 95 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 OR2B11Q5JQS5 317 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 PHB2Q99623 299 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 AIFM2Q9BRQ8 373 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 SLC5A7Q9GZV3 580 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 COA4Q9NYJ1 87 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 ADAM30Q9UKF2 790 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 SAP30O75446 220 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 FGF2P09038 288 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 CD69Q07108 199 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 BORCS5Q969J3 196 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 IFT46Q9NQC8 304 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 BET1LQ9NYM9 111 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf3-215ENST00000478473 FAM223BA6NKX1 122 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 TEX22C9J3V5 150 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF735P0CB33 412 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 PRSS3P35030 304 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 VBP1P61758 197 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF45Q02386 682 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 VAX1Q5SQQ9 334 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 C10orf55Q5SWW7 151 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 SLC25A42Q86VD7 318 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 FAM223AQ8IWN6 122 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 OR4A5Q8NH83 315 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 GPX8Q8TED1 209 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 GPHA2Q96T91 129 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf3-215ENST00000478473 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms