RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, humanhuman

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1-210ENST00000469034 BRCA2P51587 3418 aa3.91□□□□□ -1.78
SUMO1-210ENST00000469034 F5P12259 2224 aa3.9□□□□□ -1.78
SUMO1-210ENST00000469034 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 A0A1W2PR80 420 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 TMEM210A6NLX4 147 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 PPP5D1E7EU14 171 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 HS3ST1O14792 307 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 PAGE4O60829 102 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 RHBDL1O75783 438 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 TOMM40O96008 361 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 MBP02144 154 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 CCL2P13500 99 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 CD99P14209 185 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 TUBG1P23258 451 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 IL3RAP26951 378 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 S100GP29377 79 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 PSMB3P49720 205 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 TDGF1P3P51864 188 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 LBX1P52954 281 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 ERVFC1-1P60608 527 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 ERVK11-1P61568 191 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 GNB1P62873 340 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 LCN2P80188 198 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 TFF3Q07654 80 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 Q0VFX4 171 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 HNF4GQ14541 408 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 IL11RAQ14626 422 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 IGFBP7Q16270 282 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 FAM78BQ5VT40 261 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 TCEAL6Q6IPX3 200 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 TMEM108Q6UXF1 575 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 WDR86Q86TI4 376 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 TMEM256Q8N2U0 113 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 FGFRL1Q8N441 504 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 DRAM1Q8N682 238 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 OR4F5Q8NH21 305 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 NEK7Q8TDX7 302 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 SAP25Q8TEE9 199 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 ABHD3Q8WU67 409 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 PSMF1Q92530 271 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 RDH5Q92781 318 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 TMEM18Q96B42 140 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 OR5B12Q96R08 314 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 OR4F4Q96R69 305 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 ATG101Q9BSB4 218 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 SLC25A22Q9H936 323 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 MANBALQ9NQG1 85 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 DEPPQ9NTK1 212 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 FKBP11Q9NYL4 201 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 PTPRBP23467 1997 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 SEC16AO15027 2179 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 ASXL3Q9C0F0 2248 aa3.9□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 MED12Q93074 2177 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 A0A1B0GUS0 222 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 A0A1W2PPQ1 181 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 ODAMA1E959 279 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 C5orf49A4QMS7 147 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 LRRC30A6NM36 301 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 J3QT63 122 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 K7ESF4 209 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 M0R143 59 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 RAB29O14966 203 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 GAS8-AS1O95177 125 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 IGHV3-9P01782 118 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 ESDP10768 282 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 CD82P27701 267 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 OR10J1P30954 320 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 CHRNA7P36544 502 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 WNT5AP41221 380 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 LHX2P50458 406 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 CASP6P55212 293 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 SOX8P57073 446 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 SELENOTP62341 195 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 GNG3P63215 75 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 PAX5Q02548 391 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 IQCJQ1A5X6 159 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.89□□□□□ -1.79
SUMO1-210ENST00000469034 DCAF10Q5QP82 559 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms