RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468864.1

TRAPPC10-207, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 3,909 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-207ENST00000468864 DHRS13Q6UX07 377 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 CCL17Q92583 94 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 OR2V2Q96R30 315 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 EGLN1Q9GZT9 426 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 TMPRSS2O15393 492 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 OR8B3Q8NGG8 313 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 SARAFQ96BY9 339 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 OR8B2Q96RD0 313 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 GAGE10A6NGK3 116 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 FAM131CQ96AQ9 280 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 WDYHV1Q96HA8 205 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 C18orf12Q96KH6 178 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.01□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 NPIPB13A6NJU9 1138 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 NPIPB4C9JG80 1138 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 WISP1O95388 367 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 IGKV1D-12P01611 117 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 MT-ND6P03923 174 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 NMUP48645 174 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 ID3Q02535 119 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 MMDQ15546 238 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 PRR31Q5SQ13 230 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 CDPF1Q6NVV7 123 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 HARBI1Q96MB7 349 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 CXXC4Q9H2H0 198 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 TTC28Q96AY4 2481 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 TSC2P49815 1807 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 C5orf67F2Z3F1 127 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 WNT9BO14905 357 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 LEPROTL1O95214 131 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 MPZP25189 248 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 TSPAN7P41732 249 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 LGALS4P56470 323 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 KCNMB1Q16558 191 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 CENPWQ5EE01 88 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 NPCDR1Q9BY65 106 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 USF3Q68DE3 2245 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 PMS2P1A4D2B8 440 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 FAM157AC9JC47 383 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 EFNA2O43921 213 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 RFPL3SP0C7P2 107 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 C1QL4Q86Z23 238 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 VOPP1Q96AW1 172 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 ISLRO14498 428 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 IGHV2-70P01814 119 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 HLA-DQA1P01909 254 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 LINC00869P0C866 280 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 BMPERQ8N8U9 685 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 OR8G5Q8NG78 346 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 HES7Q9BYE0 225 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 C17orf98A8MV24 154 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 EREGO14944 169 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 NUDT3O95989 172 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 CGAP01215 116 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 ZNF766Q5HY98 468 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 CT55Q8WUE5 264 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 PRDX2P32119 198 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 TNXAQ16473 311 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 NEU1Q99519 415 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 PAXXQ9BUH6 204 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 A0A1B0GUS0 222 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 A0A1B0GWJ7 208 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 CORTO00230 105 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 COX7A1P24310 79 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 LCN2P80188 198 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 OR5R1Q8NH85 324 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.99□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.98□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.98□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 PGPA6NDG6 321 aa8.98□□□□□ -0.97
TRAPPC10-207ENST00000468864 GCHFRP30047 84 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms