RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 EFEMP2O95967 443 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0B4J293 547 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 PATE3B3GLJ2 98 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A17O43808 307 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFRSF9Q07011 255 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 FXYD3Q14802 87 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 OR8G5Q8NG78 346 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 PKIBQ9C010 78 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 MARCH11A6NNE9 402 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 B4E171 279 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 CCL21O00585 134 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDT3O95989 172 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 IL11P20809 199 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 CRYBB3P26998 211 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 SYT8Q8NBV8 401 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 GPHA2Q96T91 129 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 DDA1Q9BW61 102 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 PRSS8Q16651 343 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 AQP3Q92482 292 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 PARLQ9H300 379 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM250H0YL14 139 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM106CPP0CH98 169 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 TCF19Q9Y242 345 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 TRGC1P0CF51 173 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 NEU1Q99519 415 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 CBLN4Q9NTU7 201 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 CALYQ9NYX4 217 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 MED13LQ71F56 2210 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV3-15P01624 115 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV4-34P06331 123 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 DANCRP0C864 163 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 MFAP4P55083 255 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 HERPUD1Q15011 391 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 SHISA5Q8N114 240 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 MARVELD3Q96A59 401 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 PILRAQ9UKJ1 303 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 GDF9O60383 454 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 LMX1BO60663 402 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 ZG16O60844 167 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 ID4P47928 161 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 IFITM2Q01629 132 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 TFF2Q03403 129 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 FUT5Q11128 374 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 DNLZQ5SXM8 178 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 GALNT14Q96FL9 552 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 LHFPL6Q9Y693 200 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 OBSL1O75147 1896 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 LNP1A1A4G5 178 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 CGB1A6NKQ9 187 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 C17orf51A8MQB3 221 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFA2O43678 99 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 ANOS1P23352 680 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 AMY1AP04745 511 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms