RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
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ODC1-202ENST00000405333 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP16.26■□□□□ 0.19
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ODC1-202ENST00000405333 RHOVQ96L33 236 aa16.26■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 DPM3Q9P2X0 92 aa16.26■□□□□ 0.19
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ODC1-202ENST00000405333 CEACAM3P40198 252 aa16.21■□□□□ 0.19
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ODC1-202ENST00000405333 CLEC9AQ6UXN8 241 aa16.21■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 CFHR4Q92496 578 aa16.21■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
ODC1-202ENST00000405333 L7N2F9 121 aa16.2■□□□□ 0.18
ODC1-202ENST00000405333 NPFFO15130 113 aa16.2■□□□□ 0.18
ODC1-202ENST00000405333 TSC22D2O75157 780 aa16.2■□□□□ 0.18
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