RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
TPGS1-201ENST00000359315 WFDC9Q8NEX5 89 aa21.02■□□□□ 0.96
TPGS1-201ENST00000359315 RAX2Q96IS3 184 aa21.02■□□□□ 0.96
TPGS1-201ENST00000359315 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
TPGS1-201ENST00000359315 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
TPGS1-201ENST00000359315 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa21.02■□□□□ 0.96
TPGS1-201ENST00000359315 RAMP3O60896 148 aa21.01■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 IGLL1P15814 213 aa21.01■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 CD33P20138 364 aa21.01■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 ASPHD1Q5U4P2 390 aa21.01■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 TEX45Q8NA69 505 aa21.01■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 OR4S2Q8NH73 311 aa21.01■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 P2RX4Q99571 388 aa21.01■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 M0QYG6 137 aa21■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 RAB9AP51151 201 aa21■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 PRSS8Q16651 343 aa21■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 BEAN1Q3B7T3 259 aa21■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 OR5B12Q96R08 314 aa21■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 PLXNB1O43157 2135 aa20.99■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 CNIH1O95406 144 aa20.99■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 DGCR2P98153 550 aa20.99■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 ACTBL2Q562R1 376 aa20.99■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 C10orf55Q5SWW7 151 aa20.99■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM65Q6PI78 240 aa20.99■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF491Q8N8L2 437 aa20.99■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB34Q8NCN2 500 aa20.99■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 OR51H1Q8NH63 302 aa20.99■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 C4orf3Q8WVX3 66 aa20.99■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 APELAP0DMC3 54 aa20.98■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 MYCNOSP40205 109 aa20.98■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 TNXAQ16473 311 aa20.98■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 AKIRIN2Q53H80 203 aa20.98■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 SPAG16Q8N0X2 631 aa20.98■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa20.98■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 OR6F1Q8NGZ6 308 aa20.98■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 CCL24O00175 119 aa20.97■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 WIPF1O43516 503 aa20.97■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 SLC6A1P30531 599 aa20.97■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 AADACL3Q5VUY0 350 aa20.97■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 MS4A10Q96PG2 267 aa20.97■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 MTFP1Q9UDX5 166 aa20.97■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 RLN1P04808 185 aa20.96■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 VAX1Q5SQQ9 334 aa20.96■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 SSX9Q7RTT3 188 aa20.96■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 OR5T1Q8NG75 326 aa20.96■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2E2Q96LR5 201 aa20.96■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC160A6NGH7 325 aa20.95■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 TPPPO94811 219 aa20.95■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 CD3DP04234 171 aa20.95■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 KIR2DS2P43631 304 aa20.95■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 TSPAN5P62079 268 aa20.95■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 CATR1Q13166 79 aa20.95■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 OR5M8Q8NGP6 311 aa20.95■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 MSGN1A6NI15 193 aa20.94■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 I3L521 148 aa20.94■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 OR4D10Q8NGI6 311 aa20.94■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.94■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 RHOVQ96L33 236 aa20.94■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 VSIG4Q9Y279 399 aa20.94■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 KBTBD11O94819 623 aa20.93■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 S1PR2O95136 353 aa20.93■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 MYOD1P15172 320 aa20.93■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 RAB25P57735 213 aa20.93■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 DEFA5Q01523 94 aa20.93■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 PHLDA2Q53GA4 152 aa20.93■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 MCFD2Q8NI22 146 aa20.93■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 FCAMRQ8WWV6 532 aa20.93■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 GABARAPH6UMI1 98 aa20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.942e-6■■■□□ 17.7
TPGS1-201ENST00000359315 OR2A4O95047 310 aa20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV3-11P01762 117 aa20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 TPPP2P59282 170 aa20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 FHL3Q13643 280 aa20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 IL18Q14116 193 aa20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 MMD2Q8IY49 270 aa20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 POC5Q8NA72 575 aa20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 OR2A7Q96R45 310 aa20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 NOTCH1P46531 2555 aa20.92■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 GPR31O00270 319 aa20.91■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 PYHIN1Q6K0P9 492 aa20.91■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 OR11H1Q8NG94 326 aa20.91■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 C15orf40Q8WUR7 153 aa20.91■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 SMIM4Q8WVI0 70 aa20.91■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 PHB2Q99623 299 aa20.91■□□□□ 0.94
TPGS1-201ENST00000359315 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms