RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A17O43808 307 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 B3GALNT1O75752 331 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 HRASP01112 189 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 IGHG2P01859 326 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 COMPP49747 757 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 TAS2R31P59538 309 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 ASAH1Q13510 395 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 POU2AF1Q16633 256 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 VMA21Q3ZAQ7 101 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF585BQ52M93 769 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 TEX45Q8NA69 505 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 LINC01006Q8NI28 216 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM230Q96A57 120 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 FBXL15Q9H469 300 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 KCNAB3O43448 404 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 S1PR2O95136 353 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 NQO2P16083 231 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 MDKP21741 143 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 SLC6A1P30531 599 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 LIN54Q6MZP7 749 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 VSTM2AQ8TAG5 236 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 GALNT14Q96FL9 552 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 RHOVQ96L33 236 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 TP53RKQ96S44 253 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 TSC22D3Q99576 134 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 AIFM2Q9BRQ8 373 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 NAA60Q9H7X0 242 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 BEX1Q9HBH7 125 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 SERTAD4Q9NUC0 356 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 RPA2P15927 270 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 UCP1P25874 307 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 LPAR6P43657 344 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 PLGLAQ15195 96 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 AWAT1Q58HT5 328 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 C9orf152Q5JTZ5 239 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 CADM3Q8N126 398 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 HSPB9Q9BQS6 159 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 BET1LQ9NYM9 111 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF580Q9UK33 172 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 MARCH11A6NNE9 402 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 OR2A4O95047 310 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 OR5AC1P0C628 307 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 PROK1P58294 105 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 DHODHQ02127 395 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM128Q5BJH2 165 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 MZT2BQ6NZ67 158 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SLC35E3Q7Z769 313 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SGPP2Q8IWX5 399 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 CENPSQ8N2Z9 138 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 R3HDM4Q96D70 268 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 OR2A7Q96R45 310 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 MDFIQ99750 246 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 WNT10AQ9GZT5 417 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM222Q9H0R3 208 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 RNF114Q9Y508 228 aa10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 AP4M1O00189 453 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 FCN1O00602 326 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 KBTBD11O94819 623 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 CA2P00918 260 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV1-39P01597 117 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV1D-39P04432 117 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 IGF1P05019 195 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SERPINE2P07093 398 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 FGF2P09038 288 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 CX3CL1P78423 397 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS8Q16651 343 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM95Q3KNT9 176 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 OR4A47Q6IF82 309 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 TMED4Q7Z7H5 227 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A42Q86VD7 318 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 FOXRED2Q8IWF2 684 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 MMD2Q8IY49 270 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 OR4A5Q8NH83 315 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 OR51J1Q9H342 316 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC42-201ENST00000293845 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms