RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 JMJD8Q96S16 334 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0G2JK05 382 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 J3QRE1 110 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 UBE2L6O14933 153 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 ZIC3O60481 467 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 ANK1P16157 1881 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 ANOS1P23352 680 aa7.68□□□□□ -1.18
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PTPRB-201ENST00000261266 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.67□□□□□ -1.18
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PTPRB-201ENST00000261266 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.67□□□□□ -1.18
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PTPRB-201ENST00000261266 MTURNQ8N3F0 131 aa7.66□□□□□ -1.18
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PTPRB-201ENST00000261266 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
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PTPRB-201ENST00000261266 CX3CL1P78423 397 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 CCL8P80075 99 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 RRN3P1Q2M238 152 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.66□□□□□ -1.18
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PTPRB-201ENST00000261266 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.66□□□□□ -1.18
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PTPRB-201ENST00000261266 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 LHX2P50458 406 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 MFAP2P55001 183 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 CACNG7P62955 275 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 MOSP00540 346 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 CKS2P33552 79 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 MESP2Q0VG99 397 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 FXYD3Q14802 87 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 DDB2Q92466 427 aa7.66□□□□□ -1.18
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