RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ZNF735P0CB33 412 aa17.43■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 OPN1MW2P0DN77 364 aa17.43■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 OPN1MW3P0DN78 364 aa17.43■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 PSMB8P28062 276 aa17.43■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 FOXE3Q13461 319 aa17.43■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 IDO2Q6ZQW0 420 aa17.43■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 TRAV41A0A0B4J266 112 aa17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 ELANEP08246 267 aa17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 UCP3P55916 312 aa17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 FXYD3Q14802 87 aa17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 SPAG16Q8N0X2 631 aa17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 OR4S2Q8NH73 311 aa17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 RSRP1Q9BUV0 290 aa17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 KLK15Q9H2R5 256 aa17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 NDUFA13Q9P0J0 144 aa17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 V9GYH0 126 aa17.42■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 TBPP20226 339 aa17.41■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R19P59542 299 aa17.41■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 PRSS8Q16651 343 aa17.41■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 VMA21Q3ZAQ7 101 aa17.41■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 CCDC190Q86UF4 302 aa17.41■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 MYOZ3Q8TDC0 251 aa17.41■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 R3HDM4Q96D70 268 aa17.41■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 ZFP57Q9NU63 452 aa17.41■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 GPR31O00270 319 aa17.4■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DS2P43631 304 aa17.4■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 AKIRIN2Q53H80 203 aa17.4■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 STEAP1BQ6NZ63 245 aa17.4■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 ARRDC1Q8N5I2 433 aa17.4■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 LFNGQ8NES3 379 aa17.4■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 OR51H1Q8NH63 302 aa17.4■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 ARPC1AQ92747 370 aa17.4■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 MRGPRFQ96AM1 343 aa17.4■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SYF2-201ENST00000236273 RAB3DO95716 219 aa17.39■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 CATR1Q13166 79 aa17.39■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 ZNF79Q15937 498 aa17.39■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 ECSCRQ19T08 205 aa17.39■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 ASPHD1Q5U4P2 390 aa17.39■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 FAAP20Q6NZ36 180 aa17.39■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 BORCS5Q969J3 196 aa17.39■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 RLN1P04808 185 aa17.38■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 IFNA6P05013 189 aa17.38■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 ZNF585BQ52M93 769 aa17.38■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 PHLDA2Q53GA4 152 aa17.38■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 LPCAT3Q6P1A2 487 aa17.38■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 OR4F17Q8NGA8 305 aa17.38■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa17.38■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 RHOVQ96L33 236 aa17.38■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 OR4F4Q96R69 305 aa17.38■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa17.37■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 HPRT1P00492 218 aa17.37■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 GNB1P62873 340 aa17.37■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 POU2AF1Q16633 256 aa17.37■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa17.37■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 ETV3LQ6ZN32 361 aa17.37■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 SLC38A6Q8IZM9 456 aa17.37■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 TERB2Q8NHR7 220 aa17.37■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 GRPEL2Q8TAA5 225 aa17.37■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa17.37■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PN81 502 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 OR2A4O95047 310 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 CNIH1O95406 144 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 F2RP25116 425 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 CHRNA7P36544 502 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 ETV6P41212 452 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 RAB9AP51151 201 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 CMTM1Q8IZ96 169 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 OR4C16Q8NGL9 310 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 ABHD5Q8WTS1 349 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 OR2A7Q96R45 310 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHA2Q9HB19 425 aa17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 NOTCH3Q9UM47 2321 aa17.35■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 KBTBD11O94819 623 aa17.35■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 S1PR2O95136 353 aa17.35■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 HRASP01112 189 aa17.35■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 S100A5P33763 92 aa17.35■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R31P59538 309 aa17.35■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 C8orf86Q6ZUL3 223 aa17.35■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 SSX9Q7RTT3 188 aa17.35■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 ZNF491Q8N8L2 437 aa17.35■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 CD300LFQ8TDQ1 290 aa17.35■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 CASTOR1Q8WTX7 329 aa17.35■□□□□ 0.37
SYF2-201ENST00000236273 TRIM63Q969Q1 353 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms