RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.94□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.94□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 KPTNQ9Y664 436 aa14.94□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.94□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 PLAUP00749 431 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 SMIM6P0DI80 62 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 OR13C7P0DN81 318 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 IRF2P14316 349 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 AKR1C3P42330 323 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 MMP23AO75900 390 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 PAX6P26367 422 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 HAGHQ16775 308 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.93□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 ERVFRD-1P60508 538 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 SSX7Q7RTT5 188 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 RPRMQ9NS64 109 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 PMS2P5A8MQ11 134 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 TMPRSS2O15393 492 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 HPRT1P00492 218 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 AGAP20933 346 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 GNG10P50151 68 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 C20orf24Q9BUV8 137 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.92□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 A1L4Q6 167 aa14.91□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 PLA2G2AP14555 144 aa14.91□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 ZNF726P1Q15940 193 aa14.91□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 A0A1B0GW64 132 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 CRYBA1P05813 215 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 TNFRSF1AP19438 455 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 TLE4Q04727 773 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 KIAA1456Q9P272 454 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 FCN3O75636 299 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 FBP1P09467 338 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 NDUFB7P17568 137 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 AWAT1Q58HT5 328 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 DDB2Q92466 427 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 S1PR3Q99500 378 aa14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
USP18-201ENST00000215794 SHISA9B4DS77 424 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 RNF212Q495C1 297 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 LYG1Q8N1E2 194 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 SMCO4Q9NRQ5 59 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 BTBD17A6NE02 478 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 E7EQL1 145 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 OR8U8P0C7N1 319 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 RAB7AP51149 207 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 ICAM4Q14773 271 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 LCN15Q6UWW0 184 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 DIRC2Q96SL1 478 aa14.89□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 IFNA17P01571 189 aa14.88□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.88□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 CCL17Q92583 94 aa14.88□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.88□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 C1orf196B1AJZ1 125 aa14.87□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 M0R036 132 aa14.87□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 ITGB1BP1O14713 200 aa14.87□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 CEBPGP53567 150 aa14.87□□□□□ -0.03
USP18-201ENST00000215794 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms