RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Snai2P97469 269 aa13.49□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1357Q7TQU7 313 aa13.49□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Srsf7Q8BL97 267 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gipc3Q8R5M0 297 aa13.49□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tlcd2Q8VC26 310 aa13.49□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rtn4ip1Q924D0 396 aa13.49□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wdr77Q99J09 342 aa13.49□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arrdc1Q99KN1 434 aa13.49□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Flywch2Q9CQE9 139 aa13.49□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lrrc3cA0A1B0GRI5 255 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ear14F6YUX7 155 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm6594J3QM43 95 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rnase2O35291 155 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc6a1P31648 599 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Id4P41139 161 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rims4P60191 269 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem184aQ3UFJ6 425 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Degs2Q8R2F2 323 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1350Q8VF34 308 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lypd8Q9D7S0 255 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr19Q9JHB2 309 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prss30Q9QYZ9 310 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm21294A0A087WS79 222 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 A0A1Y7VLU2 103 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mtatp6P00848 226 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ifna1P01572 189 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 DaoP18894 345 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Clec3bP43025 202 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem230Q8CIB6 120 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cysltr2Q920A1 309 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ackr1Q9QUI6 334 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hacd1Q9QY80 281 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rnf7Q9WTZ1 113 aa13.48□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trbv15A0A0A6YYE3 115 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 4930402F06RikA2AUQ8 332 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Scgb1b30A2BH64 92 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prr19B2RW88 366 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fgf2P15655 154 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spata46Q4FZF2 204 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 2900092C05RikQ5I0V9 184 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Psg17Q62056 475 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr876Q7TRE4 310 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr259Q7TS20 312 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem221Q8K071 230 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Katnal1Q8K0T4 488 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arl6ip5Q8R5J9 188 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1184Q8VG86 311 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Elp5Q99L85 300 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mrps24Q9CQV5 167 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp5sQ9CRA7 200 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem37Q9JJV3 211 aa13.47□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 TncQ80YX1 2110 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm17657E9PWY5 170 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr613E9PYB4 317 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lipo5F6QKH6 233 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mdga2P60755 949 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sec61a1P61620 476 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 McidasQ3UZ45 379 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Psg26Q4KL65 475 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Taar8bQ5QD06 344 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prdx2Q61171 198 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr487Q7TRU9 314 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Galnt14Q8BVG5 550 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cd226Q8K4F0 333 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r235Q8R297 328 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r59Q8R2B9 310 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prodh2Q8VCZ9 456 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr720Q8VF37 316 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1238Q8VG59 315 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cacng8Q8VHW2 423 aa13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 TsnaxQ9QZE7 290 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ighv5-15A0A0A6YWC7 117 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Iglv3A0A0B4J1K5 122 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 SdcbpO08992 299 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prrt1O35449 306 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 LoxP28301 411 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mep1aP28825 747 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 AesP63002 197 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp30Q60585 533 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Klf2Q60843 354 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1283Q7TQY4 305 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1212Q7TR08 311 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem267Q8VDR5 215 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eva1aQ91WM6 156 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tomm40lQ9CZR3 308 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sun5Q9DA32 373 aa13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ergic1Q9DC16 290 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 TracA0A075B662 137 aa13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm15217A2CG07 155 aa13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm20481G3UXK4 153 aa13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr92L7N475 312 aa13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 LplP11152 474 aa13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 P18525 117 aa13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gabra2P26048 451 aa13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Stfa2P35174 103 aa13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rpl29P47915 160 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam222bQ6P539 562 aa13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr924Q7TRB8 308 aa13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tox3Q80W03 575 aa13.45□□□□□ -0.26
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sdhaf2Q8C6I2 164 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.8 ms