RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A STP4Q07351 490 aa3.58□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A PRP22P24384 1145 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A PXA1P41909 870 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A ATP23P53722 227 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A TDA9Q04545 1251 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A POB3Q04636 552 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A ZPS1Q12512 249 aa3.57□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A AQY1P0CD91 305 aa3.56□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A TUP1P16649 713 aa3.56□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A PMA2P19657 947 aa3.56□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A MRPL7P36519 292 aa3.56□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.56□□□□□ -1.84not detected
YMR001C-AYMR001C-A THI6P41835 540 aa3.56□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A PSA1P41940 361 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A BFA1P47113 574 aa3.56□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A MFM1Q02783 413 aa3.56□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A BEM3P32873 1128 aa3.55□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A CDS1P38221 457 aa3.55□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A TDA3P38758 523 aa3.55□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A PIH1P38768 344 aa3.55□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A YGR054WP53235 642 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A EFR3Q03653 782 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A ORM2Q06144 216 aa3.55□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A PRS5Q12265 496 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A SEC3P33332 1336 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A RPS17AP02407 136 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A CPA2P03965 1118 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A SWI6P09959 803 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A RPS17BP14127 136 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A YUR1P26725 428 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A CNE1P27825 502 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A PRE4P30657 266 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A ECM32P32644 1121 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A FTR1P40088 404 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A SPO1P53541 631 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A NOP15P53927 220 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A YNL018CP53976 612 aa3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A HEM1P09950 548 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A MRPL9P31334 269 aa3.53□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A MGS1P40151 587 aa3.53□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A YJL043WP47053 257 aa3.53□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A FDC1Q03034 503 aa3.53□□□□□ -1.84
YMR001C-AYMR001C-A DUN1P39009 513 aa3.52□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A RET2P43621 546 aa3.52□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A YJR096WP47137 282 aa3.52□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A SDA1P53313 767 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A COQ6P53318 479 aa3.52□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A BUD17P53727 317 aa3.52□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A YPL068CQ02749 293 aa3.52□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A GLN4P13188 809 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A EHT1P38295 451 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A EXO1P39875 702 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A MEP2P41948 499 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A OSW7P43611 510 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A STB2P46679 850 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A NMD5P46970 1048 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A TAF4P50105 388 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A YPL216WQ08964 1102 aa3.51□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A RPL8AP17076 256 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A RPC34P32910 317 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A CKB2P38930 258 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A YFL015CP43578 164 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A RSC9Q03124 581 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A PPN1Q04119 674 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A IRC3Q06683 689 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A YDL073WQ07454 984 aa3.5□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A WHI2P12611 486 aa3.49□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A SEC65P29478 273 aa3.49□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A HXT6P39003 570 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A HXT7P39004 570 aa3.49□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A PRM2P40534 656 aa3.49□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A BST1P43571 1029 aa3.49□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A IES1P43579 692 aa3.49□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A RPS15Q01855 142 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A RNR3P21672 869 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A PRP19P32523 503 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A FAT1P38225 669 aa3.48□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A ATG36P46983 293 aa3.48□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A YGR153WP48238 217 aa3.48□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A ERG13P54839 491 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A NOP14Q99207 810 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A SFP1P32432 683 aa3.47□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A MTC7P32633 139 aa3.47□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A YPT10P38146 199 aa3.47□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A YHR033WP38690 423 aa3.47□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A YEL025CP39991 1188 aa3.47□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A IRC8P47046 822 aa3.47□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A ECM9Q02202 377 aa3.47□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A HLR1Q04429 423 aa3.47□□□□□ -1.85
YMR001C-AYMR001C-A HOP1P20050 605 aa3.46□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A URE2P23202 354 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.46□□□□□ -1.86not detected
YMR001C-AYMR001C-A SNO3P43544 222 aa3.46□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A YDL183CP48569 320 aa3.46□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A SAP4P53036 818 aa3.46□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A NSE5Q03718 556 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 143.4 ms