RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638157.1

GRAMD1B-216, Transcript of GRAM domain containing 1B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GRAMD1B, Length 3,849 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1B-216ENST00000638157 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.97□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.97□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.97□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 RTL1A6NKG5 1358 aa14.97□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 SASH3O75995 380 aa14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 PTPRCP08575 1304 aa14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 MTX1Q13505 466 aa14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 EXOC4Q96A65 974 aa14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 DHX58Q96C10 678 aa14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
GRAMD1B-216ENST00000638157 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.96□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CYP27B1O15528 508 aa14.96□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 ATP1A3P13637 1013 aa14.96□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.96□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.96□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.96□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 DCCP43146 1447 aa14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CCZ1BP86790 482 aa14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 FANCCQ00597 558 aa14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 COPS6Q7L5N1 327 aa14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 E2F5Q15329 346 aa14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 RGS12O14924 1447 aa14.95□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 H3BQF6 201 aa14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 GPTP24298 496 aa14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CTAGE5O15320 804 aa14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 MYD88Q99836 296 aa14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 AFF2P51816 1311 aa14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.94□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 SGSM2O43147 1006 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CBFA2T2O43439 604 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 TBC1D8O95759 1140 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CTAGE8P0CG41 777 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 KCNQ4P56696 695 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 FAM227BQ96M60 508 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 HYPKQ9NX55 129 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 PGBD1Q96JS3 809 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 ELP1O95163 1332 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 A1BGP04217 495 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.93□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 NDUFAB1O14561 156 aa14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 ABCB6Q9NP58 842 aa14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 ABCC4O15439 1325 aa14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 APOBRQ0VD83 1088 aa14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 ANKRD1Q15327 319 aa14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 WDR24Q96S15 920 aa14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GRAMD1B-216ENST00000638157 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms