RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 CDKL5O76039 1030 aa21.68■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 LIG1P18858 919 aa21.68■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.68■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 TNMDQ9H2S6 317 aa21.68■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 NYXQ9GZU5 481 aa21.67■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 NAPBQ9H115 298 aa21.67■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.67■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.67■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.67■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 MBD4O95243 580 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 NBPF3Q9H094 633 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 DACT1Q9NYF0 836 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 SCN7AQ01118 1682 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 UBE4AQ14139 1066 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 C8orf76Q96K31 380 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 C8orf37Q96NL8 207 aa21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 BCAMP50895 628 aa21.65■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 ERFEQ4G0M1 354 aa21.65■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 PGBD1Q96JS3 809 aa21.65■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 KRT23Q9C075 422 aa21.65■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 BRAPQ7Z569 592 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.64■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 FOSBP53539 338 aa21.64■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 CTAGE5O15320 804 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 KDM4AO75164 1064 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 NARFQ9UHQ1 456 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.63■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 RPS6KA4O75676 772 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 CAVIN2O95810 425 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 MTA3Q9BTC8 594 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 ARMT1Q9H993 441 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.62■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 B4E1Z4 1266 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 SNAP23O00161 211 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 LIFRP42702 1097 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 TYRO3Q06418 890 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 C4AP0C0L4 1744 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 C4BP0C0L5 1744 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 TDO2P48775 406 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 GUCY1B3Q02153 619 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 USP28Q96RU2 1077 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 USP25Q9UHP3 1055 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.61■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 ZBTB43O43298 467 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 CAMK4Q16566 473 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 SETDB2Q96T68 719 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 CHD4Q14839 1912 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 A0A1B0GUL6 1792 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 NEDD4P46934 1319 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 SOCS7O14512 581 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 SEMA3EO15041 775 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 ZPR1O75312 459 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 NR1I2O75469 434 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 ADCY5O95622 1261 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 APOA5Q6Q788 366 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 NHSQ6T4R5 1651 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 VPS37DQ86XT2 251 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms