RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	FGD1	P98174	961 aa		18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	ALX1	Q15699	326 aa		18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	NBPF3	Q9H094	633 aa		18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	CHST3	Q7LGC8	479 aa		18.87	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		18.87	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		18.87	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		18.86	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	PRKAB2	O43741	272 aa		18.86	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	STK3	Q13188	491 aa		18.86	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	MSL1	Q68DK7	614 aa		18.86	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		18.86	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF384	Q8TF68	577 aa		18.86	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	GJB2	P29033	226 aa		18.86	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	ZBTB22	O15209	634 aa		18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	CACNA1S	Q13698	1873 aa		18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	ZMYM6	O95789	1325 aa		18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	GNAT2	P19087	354 aa		18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	NCOA7	Q8NI08	942 aa		18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	NAPB	Q9H115	298 aa		18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		18.85	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	UFL1	O94874	794 aa		18.84	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	SYT1	P21579	422 aa		18.84	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	JAG2	Q9Y219	1238 aa		18.84	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		18.84	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	TRAK2	O60296	914 aa		18.84	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	SRGN	P10124	158 aa		18.84	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	ATP2B4	P23634	1241 aa		18.84	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	GTF3C6	Q969F1	213 aa		18.84	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	GGA1	Q9UJY5	639 aa		18.84	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	PRDX5	P30044	214 aa		18.83	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	APOBR	Q0VD83	1088 aa		18.83	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	SLC15A2	Q16348	729 aa		18.83	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		18.83	■□□□□ 0.61
DNM1-222	ENST00000636280	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		18.83	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	MCM5	P33992	734 aa		18.83	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	MECOM	Q03112	1051 aa		18.83	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	MCTP1	Q6DN14	999 aa		18.83	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		18.83	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	FBXL16	Q8N461	479 aa		18.83	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		18.83	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		18.83	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PRC1	O43663	620 aa		18.82	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	STX6	O43752	255 aa		18.82	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	ANTXR2	P58335	489 aa		18.82	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		18.82	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	NPR1	P16066	1061 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PDE6B	P35913	854 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	TDO2	P48775	406 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	TRDN	Q13061	729 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	TMC4	Q7Z404	712 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	SP8	Q8IXZ3	490 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	POLL	Q9UGP5	575 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PFKFB2	O60825	505 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	SCRN1	Q12765	414 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		18.81	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	STK32B	Q9NY57	414 aa		18.8	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		18.8	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PTMS	P20962	102 aa		18.8	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		18.8	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		18.8	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	NEDD4	P46934	1319 aa		18.8	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		18.8	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		18.8	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	EVC	P57679	992 aa		18.79	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	CD209	Q9NNX6	404 aa		18.79	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	INCENP	Q9NQS7	918 aa		18.79	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280		B4E1Z4	1266 aa		18.79	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		18.79	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	JAK2	O60674	1132 aa		18.78	■□□□□ 0.6
DNM1-222	ENST00000636280	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		18.78	■□□□□ 0.6

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