RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		20.47	■□□□□ 0.87
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		20.47	■□□□□ 0.87
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHKA1	P46020	1223 aa		20.46	■□□□□ 0.87
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	20.46	■□□□□ 0.87
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNFAIP1	Q13829	316 aa		20.46	■□□□□ 0.87
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC102A	Q96A19	550 aa		20.46	■□□□□ 0.87
JMJD1C-211	ENST00000633035	XAGE2	Q96GT9	111 aa		20.46	■□□□□ 0.87
JMJD1C-211	ENST00000633035	COG6	Q9Y2V7	657 aa		20.46	■□□□□ 0.87
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADORA1	P30542	326 aa		20.45	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		20.45	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	AOC2	O75106	756 aa		20.44	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	NOG	Q13253	232 aa		20.44	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRIK5	Q16478	980 aa		20.44	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		20.44	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	20.44	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRI	Q9BWK5	157 aa		20.44	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		20.44	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	20.43	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNNI2	P48788	182 aa		20.43	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		20.43	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	WBP1L	Q9NX94	342 aa		20.43	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRKG1	Q13976	671 aa		20.42	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		20.42	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEP85	Q6P2H3	762 aa		20.42	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		20.41	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	20.41	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDE3A	Q14432	1141 aa		20.41	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASA3	Q14644	834 aa		20.41	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		20.41	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		20.41	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABCF2	Q9UG63	623 aa		20.41	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	20.41	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	20.41	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		20.4	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	HMMR	O75330	724 aa		20.4	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		20.4	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	MOB2	Q70IA6	237 aa		20.4	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR108	Q9NPR9	543 aa		20.4	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		20.4	■□□□□ 0.86
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXN1	O15353	648 aa		20.39	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		20.39	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRDX5	P30044	214 aa		20.39	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASGRF1	Q13972	1273 aa		20.39	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		20.39	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNNI3K	Q59H18	835 aa		20.39	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		20.39	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLF2	Q8IX21	1173 aa		20.39	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	20.39	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		20.39	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	AOX1	Q06278	1338 aa		20.38	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB22	O15209	634 aa		20.38	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		20.38	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	20.38	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		20.38	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		20.38	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		20.37	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	20.37	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	20.37	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		20.37	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		20.37	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC10A3	P09131	477 aa		20.36	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	20.36	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		20.36	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	20.36	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPATA5	Q8NB90	893 aa		20.36	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	20.36	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		20.36	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		20.35	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	20.35	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	CA12	O43570	354 aa		20.35	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	20.35	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	CACNB3	P54284	484 aa		20.35	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		20.35	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	20.35	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		20.35	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	20.34	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		20.34	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		20.34	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOOK2	Q96ED9	719 aa		20.34	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		20.34	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		20.34	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		20.34	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	LBX1	P52954	281 aa		20.33	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	20.33	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM83A	Q86UY5	434 aa		20.33	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZIC5	Q96T25	663 aa		20.33	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		20.33	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	20.33	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP40	Q9NVE5	1235 aa		20.33	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		20.33	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	FZD1	Q9UP38	647 aa		20.33	■□□□□ 0.85
JMJD1C-211	ENST00000633035	APBB1	O00213	710 aa		20.32	■□□□□ 0.84
JMJD1C-211	ENST00000633035	LDHC	P07864	332 aa		20.32	■□□□□ 0.84

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