RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 ITFG2Q969R8 447 aa20.17■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 USP44Q9H0E7 712 aa20.17■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.17■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 RNF40O75150 1001 aa20.17■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.17■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 ARHGEF10O15013 1369 aa20.17■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.17■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 VSNL1P62760 191 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 CDK19Q9BWU1 502 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 MAP3K5Q99683 1374 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM232C9JQI7 657 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 NLRP12P59046 1061 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 VSTM4Q8IW00 320 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 FAM227BQ96M60 508 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 SIL1Q9H173 461 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.16■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 CBFA2T2O43439 604 aa20.15■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 NDUFA8P51970 172 aa20.15■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 CABS1Q96KC9 395 aa20.15■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.15■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 CCT5P48643 541 aa20.14■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 POLA2Q14181 598 aa20.14■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.14■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 CEP112Q8N8E3 955 aa20.14■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 DESI2Q9BSY9 194 aa20.14■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.14■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.14■□□□□ 0.82
GLIS1-202ENST00000628545 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.14■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 POTEDQ86YR6 584 aa20.14■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 TATDN2Q93075 761 aa20.14■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 ALKQ9UM73 1620 aa20.14■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 NF2P35240 595 aa20.13■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 NECTIN2Q92692 538 aa20.13■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 TTC36A6NLP5 189 aa20.13■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 CD248Q9HCU0 757 aa20.13■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 CRB1P82279 1406 aa20.13■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 NEDD4P46934 1319 aa20.13■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 IKBKBO14920 756 aa20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 CRYMQ14894 314 aa20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 PDILTQ8N807 584 aa20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 GBP3Q9H0R5 595 aa20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 INPP5BP32019 993 aa20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 NME9Q86XW9 330 aa20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 CDC23Q9UJX2 597 aa20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 PTPRMP28827 1452 aa20.12■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 EBAG9O00559 213 aa20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 GRIK3Q13003 919 aa20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 MTX1Q13505 466 aa20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 CHUKO15111 745 aa20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 RTN2O75298 545 aa20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.11■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 STX10O60499 249 aa20.1■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 ADALQ6DHV7 355 aa20.1■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 EVI5LQ96CN4 794 aa20.1■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.1■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 ADCY2Q08462 1091 aa20.09■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.09■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.09■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 ETAA1Q9NY74 926 aa20.09■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 LTKP29376 864 aa20.09■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 ATL3Q6DD88 541 aa20.09■□□□□ 0.81
GLIS1-202ENST00000628545 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms