RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625668.2

LINC02028-223, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2028, human

TSL 5

Gene LINC02028, Length 646 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC02028-223	ENST00000625668	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		9.29	□□□□□ -0.92
LINC02028-223	ENST00000625668	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
LINC02028-223	ENST00000625668	HOXC9	P31274	260 aa		9.28	□□□□□ -0.92
LINC02028-223	ENST00000625668	AMPH	P49418	695 aa		9.28	□□□□□ -0.92
LINC02028-223	ENST00000625668	MCM6	Q14566	821 aa		9.28	□□□□□ -0.92
LINC02028-223	ENST00000625668	EML3	Q32P44	896 aa		9.28	□□□□□ -0.92
LINC02028-223	ENST00000625668	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		9.28	□□□□□ -0.92
LINC02028-223	ENST00000625668	PLVAP	Q9BX97	442 aa		9.28	□□□□□ -0.92
LINC02028-223	ENST00000625668	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		9.28	□□□□□ -0.92
LINC02028-223	ENST00000625668	FLT4	P35916	1363 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	TEAD4	Q15561	434 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	ELOA3	Q8NG57	546 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	IP6K1	Q92551	441 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	ZNF358	Q9NW07	568 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	NOD1	Q9Y239	953 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	PEAK1	Q9H792	1746 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	LTN1	O94822	1766 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	EML1	O00423	815 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	EPHA4	P54764	986 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	GTF2I	P78347	998 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	MORC1	Q86VD1	984 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	ALG2	Q9H553	416 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	SKI	P12755	728 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	INSR	P06213	1382 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	DISP2	A7MBM2	1401 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	NOS2	P35228	1153 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	DOC2B	Q14184	412 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	SYT9	Q86SS6	491 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	POLK	Q9UBT6	870 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	COG6	Q9Y2V7	657 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	LRRC37A3	O60309	1634 aa		9.23	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		9.23	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	SIN3B	O75182	1162 aa		9.23	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	ALAS2	P22557	587 aa		9.23	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	GATA4	P43694	442 aa		9.23	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	NCOA4	Q13772	614 aa		9.23	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		9.23	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		9.22	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		9.22	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.93
LINC02028-223	ENST00000625668	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		9.21	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		9.21	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		9.21	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	NBPF4	Q96M43	638 aa		9.21	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	TNS2	Q63HR2	1409 aa		9.21	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	MEGF6	O75095	1541 aa		9.21	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	RGPD5	Q99666	1765 aa		9.2	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		9.2	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		9.2	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	TNS4	Q8IZW8	715 aa		9.2	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	TNFRSF25	Q93038	417 aa		9.2	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		9.2	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		9.2	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	IL2RB	P14784	551 aa		9.19	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	PDE3B	Q13370	1112 aa		9.19	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	DDB1	Q16531	1140 aa		9.19	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	SLC30A3	Q99726	388 aa		9.19	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		9.19	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	NCAPD2	Q15021	1401 aa		9.19	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		9.18	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	SERTM1	A2A2V5	107 aa		9.18	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	USP17L5	A8MUK1	530 aa		9.18	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	MTHFS	P49914	203 aa		9.18	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		9.18	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		9.18	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		9.18	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		9.18	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		9.18	□□□□□ -0.94
LINC02028-223	ENST00000625668	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		9.17	□□□□□ -0.94

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