RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 KINO60870 393 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 ADALQ6DHV7 355 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 USP27XA6NNY8 438 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 C8orf76Q96K31 380 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PQ27 194 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PQ64 194 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PQD8 194 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC8AQ8IWT6 810 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 NCOA7Q8NI08 942 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 FBXW7Q969H0 707 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
C9orf170-201ENST00000623052 CTSWP56202 376 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 METTL24Q5JXM2 366 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NBPF11Q86T75 865 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 WDR19Q8NEZ3 1342 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF213O14771 459 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CCZ1BP86790 482 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DISP2A7MBM2 1401 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TIAM2Q8IVF5 1701 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 RXRAP19793 462 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PHKA1P46020 1223 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ANO10Q9NW15 660 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SLAIN2Q9P270 581 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 COL4A1P02462 1669 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 YEATS4O95619 227 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CDC27P30260 824 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD7Q92527 254 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 INCENPQ9NQS7 918 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BCL9O00512 1426 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SPTLC2O15270 562 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZMYND15Q9H091 742 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZMYM6O95789 1325 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF532Q9HCE3 1301 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BCORQ6W2J9 1755 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 STK38Q15208 465 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PLCH1Q4KWH8 1693 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BRAPQ7Z569 592 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PHLPP1O60346 1717 aa15.54■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC102BQ68D86 513 aa15.54■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CEP57L1Q8IYX8 460 aa15.54■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PFKFB1P16118 471 aa15.54■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PDE6AP16499 860 aa15.54■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ANO1Q5XXA6 986 aa15.54■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PDE8BO95263 885 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TNNT1P13805 278 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NCAPHQ15003 741 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NTRK3Q16288 839 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 B4E1Z4 1266 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SNAP23O00161 211 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FGFR2P21802 821 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 EVA1CP58658 441 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 APOA5Q6Q788 366 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PHKBQ93100 1093 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC69A6NI79 296 aa15.53■□□□□ 0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BECN2A8MW95 431 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms