RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619151.4

BRF1-221, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene BRF1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-221	ENST00000619151	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC93	Q567U6	631 aa		33.17	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		33.17	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	MPND	Q8N594	471 aa		33.17	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		33.16	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		33.16	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	LTBP1	Q14766	1721 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	RUFY3	Q7L099	469 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	TTC14	Q96N46	770 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		33.15	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		33.14	■■■□□ 2.9
BRF1-221	ENST00000619151	CYP21A2	P08686	494 aa		33.13	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	GNAT2	P19087	354 aa		33.13	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		33.13	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	C6orf229	H3BNL8	230 aa		33.12	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		33.12	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	CYP7A1	P22680	504 aa		33.12	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	POLL	Q9UGP5	575 aa		33.12	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		33.11	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	MBD4	O95243	580 aa		33.1	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	TMX3	Q96JJ7	454 aa		33.1	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	NEK1	Q96PY6	1258 aa		33.1	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	PSMD1	Q99460	953 aa		33.1	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		33.1	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	ZMYM6	O95789	1325 aa		33.1	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	CD209	Q9NNX6	404 aa		33.09	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	IL1R1	P14778	569 aa		33.08	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	RPS6KB1	P23443	525 aa		33.08	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	AK2	P54819	239 aa		33.08	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	ANKRD1	Q15327	319 aa		33.08	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	FOXP2	O15409	715 aa		33.07	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	FGA	P02671	866 aa		33.07	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	APP	P05067	770 aa		33.07	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.89
BRF1-221	ENST00000619151	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	ALX1	Q15699	326 aa		33.07	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		33.07	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		33.07	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	33.06	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	EYA3	Q99504	573 aa		33.06	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		33.06	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	ARMT1	Q9H993	441 aa		33.06	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		33.05	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		33.05	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		33.05	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		33.05	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		33.05	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF213	O14771	459 aa		33.04	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	CPA1	P15085	419 aa		33.04	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	CUL4A	Q13619	759 aa		33.04	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	COA1	Q9GZY4	146 aa		33.04	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	VPS33B	Q9H267	617 aa		33.03	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151		E7EWF7	191 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	NFKBIE	O00221	500 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	DDIT3	P35638	169 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	MECOM	Q03112	1051 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	LCORL	Q8N3X6	602 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	GSTO1	P78417	241 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	NAPB	Q9H115	298 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		33.02	■■■□□ 2.88
BRF1-221	ENST00000619151	PRDX5	P30044	214 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BRF1-221	ENST00000619151	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BRF1-221	ENST00000619151	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		33	■■■□□ 2.87
BRF1-221	ENST00000619151	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		33	■■■□□ 2.87
BRF1-221	ENST00000619151	LAMA4	Q16363	1823 aa		33	■■■□□ 2.87
BRF1-221	ENST00000619151	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
BRF1-221	ENST00000619151	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
BRF1-221	ENST00000619151	GPR162	Q16538	588 aa		32.98	■■■□□ 2.87
BRF1-221	ENST00000619151	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		32.98	■■■□□ 2.87
BRF1-221	ENST00000619151	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
BRF1-221	ENST00000619151	JAG2	Q9Y219	1238 aa		32.98	■■■□□ 2.87

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