RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 METTL24Q5JXM2 366 aa31.36■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 VGLL2Q8N8G2 317 aa31.36■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 ARAP2Q8WZ64 1704 aa31.35■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 GRIK5Q16478 980 aa31.35■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 PDE8BO95263 885 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 CAVIN4Q5BKX8 364 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 CDAN1Q8IWY9 1227 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 TCP10L2B9ZVM9 353 aa31.33■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa31.33■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa31.33■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 SSH1Q8WYL5 1049 aa31.33■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 USP44Q9H0E7 712 aa31.33■■■□□ 2.61
PTPRF-216ENST00000617451 E9PSI1 815 aa31.32■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 KLHDC4Q8TBB5 520 aa31.32■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN18Q99952 460 aa31.32■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM39BQ9GZU3 492 aa31.32■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 ELP3Q9H9T3 547 aa31.32■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 TNNI2P48788 182 aa31.31■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 OPTNQ96CV9 577 aa31.31■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM17Q9Y577 477 aa31.31■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 BCAMP50895 628 aa31.3■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 CRHR2Q13324 411 aa31.3■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 OTOP1Q7RTM1 612 aa31.3■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 OTOFQ9HC10 1997 aa31.3■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 CENPFP49454 3210 aa31.29■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 TEKT1Q969V4 418 aa31.28■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 MS4A4AQ96JQ5 239 aa31.28■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 MRIQ9BWK5 157 aa31.28■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 KIF16BQ96L93 1317 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 MAP3K9P80192 1104 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 ERO1AQ96HE7 468 aa31.27■■■□□ 2.6
PTPRF-216ENST00000617451 FGFR2P21802 821 aa31.26■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 SLFN5Q08AF3 891 aa31.26■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 VGLL4Q14135 290 aa31.26■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP31.26■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa31.26■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC15Q96MV8 337 aa31.26■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa31.25■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 CACNB3P54284 484 aa31.24■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 CD99L2Q8TCZ2 262 aa31.24■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 BRI3BPQ8WY22 251 aa31.23■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 CSADQ9Y600 493 aa31.23■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 EYA2O00167 538 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 SP3Q02447 781 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 ALDH1L2Q3SY69 923 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 FKBP1CQ5VVH2 108 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 FAM83AQ86UY5 434 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN22Q9Y2R2 807 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 MAST3O60307 1309 aa31.22■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 GTF2A2P52657 109 aa31.21■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
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PTPRF-216ENST00000617451 HHIPL2Q6UWX4 724 aa31.2■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 EFCC1Q9HA90 598 aa31.2■■■□□ 2.59
PTPRF-216ENST00000617451 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa31.19■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 CAP1Q01518 475 aa31.19■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 CCL15Q16663 113 aa31.19■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 LPIN2Q92539 896 aa31.19■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 OTUD5Q96G74 571 aa31.19■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 SPDYE5A6NIY4 337 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 SLC5A1P13866 664 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 ATG9AQ7Z3C6 839 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 CDCA7LQ96GN5 454 aa31.18■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 BRCA2P51587 3418 aa31.17■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 WDR66Q8TBY9 1149 aa31.17■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 HOOK2Q96ED9 719 aa31.17■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 SMC4Q9NTJ3 1288 aa31.17■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa31.17■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 FAM43AQ8N2R8 423 aa31.16■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 WRNIP1Q96S55 665 aa31.16■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa31.16■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 ERO1BQ86YB8 467 aa31.15■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 POTEFA5A3E0 1075 aa31.14■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 ARMC5Q96C12 935 aa31.14■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO3Q9UK99 471 aa31.14■■■□□ 2.58
PTPRF-216ENST00000617451 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 CETPP11597 493 aa31.12■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF15Q66K64 600 aa31.12■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 CIAO1O76071 339 aa31.11■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 SIL1Q9H173 461 aa31.11■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 IRF6O14896 467 aa31.1■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF6Q15052 776 aa31.1■■■□□ 2.57
PTPRF-216ENST00000617451 FAM151AQ8WW52 585 aa31.1■■■□□ 2.57
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