RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 TNFAIP1Q13829 316 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 SLC17A8Q8NDX2 589 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
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CTIF-211ENST00000592658 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
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CTIF-211ENST00000592658 MTFR1Q15390 333 aa16.87■□□□□ 0.29
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CTIF-211ENST00000592658 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.82■□□□□ 0.28
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CTIF-211ENST00000592658 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
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CTIF-211ENST00000592658 PPIL2Q13356 520 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 SNAPC2Q13487 334 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 CCDC184Q52MB2 194 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
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CTIF-211ENST00000592658 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 CACNA1FO60840 1977 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 F6X3S4 739 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 PLIN1O60240 522 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 BEND3Q5T5X7 828 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 CPA4Q9UI42 421 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 VAMP4O75379 141 aa16.78■□□□□ 0.28
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CTIF-211ENST00000592658 WRNIP1Q96S55 665 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 HOXD10P28358 340 aa16.77■□□□□ 0.28
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CTIF-211ENST00000592658 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
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CTIF-211ENST00000592658 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 ANKRD23Q86SG2 305 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 LRCH3Q96II8 777 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 RNF208Q9H0X6 261 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.77■□□□□ 0.28
CTIF-211ENST00000592658 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-211ENST00000592658 MYPNQ86TC9 1320 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-211ENST00000592658 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-211ENST00000592658 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-211ENST00000592658 CACNB3P54284 484 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-211ENST00000592658 PPATQ06203 517 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-211ENST00000592658 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-211ENST00000592658 VCANP13611 3396 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-211ENST00000592658 GRM8O00222 908 aa16.75■□□□□ 0.27
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