RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579814.1

LIMD2-208, Transcript of LIM domain containing 2, human

TSL 2

Gene LIMD2, Length 709 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIMD2-208	ENST00000579814	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		32.42	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	FOXN1	O15353	648 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	CCDC102B	Q68D86	513 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	TEKT1	Q969V4	418 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	PCNT	O95613	3336 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	MAST3	O60307	1309 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	XAGE2	Q96GT9	111 aa		32.4	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	TNFAIP1	Q13829	316 aa		32.39	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		32.39	■■■□□ 2.78
LIMD2-208	ENST00000579814	AOX1	Q06278	1338 aa		32.38	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	ZBTB22	O15209	634 aa		32.38	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		32.37	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		32.37	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	MOB2	Q70IA6	237 aa		32.37	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		32.37	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	RASA3	Q14644	834 aa		32.36	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	GORAB	Q5T7V8	394 aa		32.36	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		32.36	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	PRKG1	Q13976	671 aa		32.34	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	CEP85	Q6P2H3	762 aa		32.34	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	COG6	Q9Y2V7	657 aa		32.34	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		32.33	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	SLC10A3	P09131	477 aa		32.33	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	TNNI2	P48788	182 aa		32.33	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
LIMD2-208	ENST00000579814	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	RASGRF1	Q13972	1273 aa		32.32	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	ZIC5	Q96T25	663 aa		32.32	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	GPR108	Q9NPR9	543 aa		32.32	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		32.32	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		32.31	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	PRDX5	P30044	214 aa		32.3	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		32.3	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		32.3	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	CA12	O43570	354 aa		32.29	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	LBX1	P52954	281 aa		32.29	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		32.29	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	PDE3A	Q14432	1141 aa		32.28	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	TNNI3K	Q59H18	835 aa		32.28	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		32.28	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		32.27	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		32.27	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	ABCF2	Q9UG63	623 aa		32.27	■■■□□ 2.76
LIMD2-208	ENST00000579814	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		32.26	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	MAP3K11	Q16584	847 aa		32.26	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		32.25	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		32.25	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	FZD1	Q9UP38	647 aa		32.25	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		32.25	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	CACNB3	P54284	484 aa		32.24	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		32.24	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	SLF2	Q8IX21	1173 aa		32.24	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	SPATA5	Q8NB90	893 aa		32.24	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		32.24	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		32.24	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		32.24	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	UNCX	A6NJT0	531 aa		32.23	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		32.23	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	FAM83A	Q86UY5	434 aa		32.23	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		32.23	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	HMMR	O75330	724 aa		32.22	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		32.22	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		32.22	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	TEPSIN	Q96N21	525 aa		32.22	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	CSRNP1	Q96S65	589 aa		32.22	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		32.21	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		32.21	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	TNS4	Q8IZW8	715 aa		32.21	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		32.21	■■■□□ 2.75
LIMD2-208	ENST00000579814	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		32.2	■■■□□ 2.75

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