RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570051.5

RNPS1-226, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-226ENST00000570051 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.41■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 CDCA5Q96FF9 252 aa25.41■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 CRBNQ96SW2 442 aa25.41■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 MYO1BO43795 1136 aa25.4■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 TEKT1Q969V4 418 aa25.4■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 MRIQ9BWK5 157 aa25.4■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.4■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 CNTNAP1P78357 1384 aa25.4■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.39■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.39■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.39■■□□□ 1.66
RNPS1-226ENST00000570051 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 CLRN2A0PK11 232 aa25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 RASSF10A6NK89 507 aa25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 RAB11FIP3O75154 756 aa25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 MCAMP43121 646 aa25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 PI16Q6UXB8 463 aa25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 SPATA5Q8NB90 893 aa25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.38■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 APBB1O00213 710 aa25.37■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.37■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.37■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 AACSQ86V21 672 aa25.37■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.37■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.36■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.36■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.36■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.35■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.35■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 VEZTQ9HBM0 779 aa25.35■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 ABCF2Q9UG63 623 aa25.35■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.34■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.34■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-226ENST00000570051 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.32■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 JMYQ8N9B5 988 aa25.32■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 DCTPP1Q9H773 170 aa25.32■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.31■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.31■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 SNRKQ9NRH2 765 aa25.31■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 PCNTO95613 3336 aa25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 VEGFBP49765 207 aa25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 TNFAIP1Q13829 316 aa25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 GAKO14976 1311 aa25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 HUNKP57058 714 aa25.29■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 FKBP1BP68106 108 aa25.29■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 RASA3Q14644 834 aa25.29■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF384Q8TF68 577 aa25.29■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.29■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 NF2P35240 595 aa25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 ZAP70P43403 619 aa25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 CACNB3P54284 484 aa25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 MECOMQ03112 1051 aa25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 AAMPQ13685 434 aa25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 SLF2Q8IX21 1173 aa25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-226ENST00000570051 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-226ENST00000570051 TNNI2P48788 182 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-226ENST00000570051 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-226ENST00000570051 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-226ENST00000570051 CAPNS2Q96L46 248 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-226ENST00000570051 BCL11AQ9H165 835 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-226ENST00000570051 RAI14Q9P0K7 980 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-226ENST00000570051 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-226ENST00000570051 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-226ENST00000570051 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RNPS1-226ENST00000570051 ECE1P42892 770 aa25.25■■□□□ 1.63
RNPS1-226ENST00000570051 MOB2Q70IA6 237 aa25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms