RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 KCNJ4P48050 445 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PDE1AP54750 535 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 XAGE2Q96GT9 111 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PIM2Q9P1W9 311 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 GRIN3BO60391 1043 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 BBOX1O75936 387 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 UFL1O94874 794 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 SLC5A1P13866 664 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ALDH1B1P30837 517 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 BCAMP50895 628 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 SCARF1Q14162 830 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 GORABQ5T7V8 394 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 TTC22Q5TAA0 569 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PI16Q6UXB8 463 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 TTLL6Q8N841 843 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 LPIN2Q92539 896 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 CNKSR1Q969H4 720 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 SNRKQ9NRH2 765 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 POLLQ9UGP5 575 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 BCS1LQ9Y276 419 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 C6orf229H3BNL8 230 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 GPR37O15354 613 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 SP8Q8IXZ3 490 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 MPNDQ8N594 471 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 TTC13Q8NBP0 860 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 RILPL2Q969X0 211 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 GPATCH3Q96I76 525 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ANKRD2Q9GZV1 360 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 GPR108Q9NPR9 543 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 STAP2Q9UGK3 403 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 GGA1Q9UJY5 639 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 JAG2Q9Y219 1238 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 XDHP47989 1333 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 HRO43593 1189 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ATP2B4P23634 1241 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 ZAP70P43403 619 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 UBE4AQ14139 1066 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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GINS3-210ENST00000568468 TBC1D16Q8TBP0 767 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-210ENST00000568468 SLX4Q8IY92 1834 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 AOX1Q06278 1338 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 GOLIM4O00461 696 aa7.39□□□□□ -1.23
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GINS3-210ENST00000568468 CHGBP05060 677 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ATP5JP18859 108 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 SDSP20132 328 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 MCAMP43121 646 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 RASSF7Q02833 373 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 PTGDRQ13258 359 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 RASGRF1Q13972 1273 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 AOC3Q16853 763 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 VPS37DQ86XT2 251 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 DUOX1Q9NRD9 1551 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 SNED1Q8TER0 1413 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ERC2O15083 957 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 MAP3K7O43318 606 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 YY1P25490 414 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 WASHC4Q2M389 1173 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CCDC93Q567U6 631 aa7.38□□□□□ -1.23
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