RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 SZT2Q5T011 3432 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.15■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 GYG1P46976 350 aa23.15■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.32e-7■■□□□ 11.5
INO80E-212ENST00000568043 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.15■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.14■■□□□ 1.3
INO80E-212ENST00000568043 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.14■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 TNFAIP1Q13829 316 aa23.14■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 CCL15Q16663 113 aa23.14■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.14■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 MAP3K9P80192 1104 aa23.13■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.13■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.13■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.13■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 ANP32CO43423 234 aa23.12■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 CRKP46108 304 aa23.12■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.12■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 OTUD5Q96G74 571 aa23.12■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.12■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
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INO80E-212ENST00000568043 GTF2A2P52657 109 aa23.11■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 UBE4AQ14139 1066 aa23.11■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 GRM8O00222 908 aa23.1■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 CACNB3P54284 484 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 NBPF11Q86T75 865 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 KAZALD1Q96I82 304 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.09■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.08■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.08■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
INO80E-212ENST00000568043 BTBD19C9JJ37 291 aa23.07■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 TLR2O60603 784 aa23.07■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 WDR63Q8IWG1 891 aa23.07■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.07■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 CSADQ9Y600 493 aa23.07■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 H0YGN5 161 aa23.06■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 CTGFP29279 349 aa23.06■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.06■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 IRF6O14896 467 aa23.05■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 TNNI2P48788 182 aa23.05■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 ARHGEF6Q15052 776 aa23.05■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 SUCLG2Q96I99 432 aa23.05■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 ERO1BQ86YB8 467 aa23.04■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 CETPP11597 493 aa23.03■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 MTFR1Q15390 333 aa23.03■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 SHISA4Q96DD7 197 aa23.03■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 WRNIP1Q96S55 665 aa23.03■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
INO80E-212ENST00000568043 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 LRRC24Q50LG9 513 aa23.01■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 C17orf99Q6UX52 265 aa23.01■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 AK9Q5TCS8 1911 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 ALDH1L1O75891 902 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 PPIL2Q13356 520 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 SNAPC2Q13487 334 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 FAM83AQ86UY5 434 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 VGLL2Q8N8G2 317 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 TEKT1Q969V4 418 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.99■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.99■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 MGAMO43451 1857 aa22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 GNRH1P01148 92 aa22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 INPP5BP32019 993 aa22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 BCAMP50895 628 aa22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 KIF22Q14807 665 aa22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 VPS37DQ86XT2 251 aa22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 TRIM47Q96LD4 638 aa22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 MRIQ9BWK5 157 aa22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
INO80E-212ENST00000568043 CPA4Q9UI42 421 aa22.98■■□□□ 1.27
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